化学生物学小论文_(酶结构研究内容及预测方法)（毕业学术论文设计）.docVIP

化学生物学论文 班级：2009级化学生物学班 姓名： 学号：200911130 酶结构研究内容及预测方法 200911130 化学生物学班 摘要:蛋白质结构预测是生物信息学当前的主要挑战之一。生物大分子的功能主要取决于它们的三级结构、运动及相互作用。对蛋白质结构的解析可以从根本上阐明蛋白质功能的分子机制和基础，同时也是研究蛋白质功能的一个重要途径。本文阐述了当前蛋白质结构的研究的主要手段，如X射线晶体学、核磁共振波谱学和三维电镜重构方法学等及其优缺点和适用性，总结了目前蛋白质研究进展并对将来的方向进行了一些探讨。 关键词：蛋白质结构;蛋白质二级结构预测；三维结构；四级结构；氢化酶 Abstract: Protein structure prediction was one of major challenges in bio-informatics. The functions of bio-macromolecules are mainly determined by their 3D structures, movements and interactions. Structural analysis on proteins constitutes the ultimate way to elucidate the molecular mechanism and basis of their functions. This article summarizes the methodology, advantages and limits of three major methods in the current protein structural study, X-ray crystallography, and nuclear magnetic resonance and 3-dimension electron microscopy reconstitution. In addition, progress and future directions of protein structural study are discussed. Key words: protein structure； protein secondary prediction；3-dimension structure; quaternary structure；Hydrogenise 目前，蛋白质序列数据库的数据积累的速度非常快，但是一支结构的蛋白质相对较少。尽管蛋白质结构测定技术有了较为显著的进展，但是通过实验方法确定蛋白质结构的过程仍然非常复杂，代价较高。另一方面，随着DNA测序技术的发展，DNA序列分析技术和基因识别方法的进步，我们可以从DNA推导出相应的蛋白质序列。这意味着已知序列的蛋白质数量和已测定结构的蛋白质数量的差距将会越来越大。人们希望解析蛋白质结构的速度能够跟上解析蛋白质序列的速度，或者缩小两者的差距。因此发展理论分析方法就变得十分必要，这对蛋白质结构预测提出了极大的挑战。 20世纪60年代后期，Christian Anfinsen首先发现去折叠蛋白质或者变性蛋白质在允许重新折叠的实验条件下可以重新折叠到原来的结构，这种天然结构对于行使生物功能具有重要作用，大多数蛋白质只有在折叠成它们天然结构的时候才能具有完全的生物活性，提出蛋白质分子的一级序列完全决定其空间结构的著名论断。自从提出蛋白质折叠的信息隐含在蛋白质的一级结构中，科学家们对蛋白质结构的预测进行了大量的研究，分子生物学家将有可能直接运用适当的算法，从氨基酸序列出发，预测蛋白质的结构。 1 酶结构研究内容 酶是活细胞产生的一类具有催化功能的生物分子，又称为生物催化剂。绝大多数的酶都是蛋白质。酶结构的研究内容即是研究蛋白质分子的基本结构。蛋白质分子的基本结构可分为6个级别：一级结构，二级结构，超二级结构，三级结构，四级结构及分子缔合体。其中超二级结构为二级结构单元间的组合方式。作为蛋白质分子都有三级结构，在分子量超过十万的一些蛋白质分子中往往出现四级结构。 1.1酶一级结构的研究内容 蛋白质的一级结构包括组成蛋白质的多肽链数目，多肽链的氨基酸顺序，以及多肽链内或链间二硫键的数目和位置。其中最重要的是多肽链的氨基酸顺序，它是蛋白质生物功能的基础。蛋白质氨基酸顺序的改变，不仅将影响蛋白质的高级结构，而且将直接影响其生物功能。 测定蛋白质一级结构并作出肽谱的重要性在于：①可用于分子克隆忠寡核苷酸探针的制备；②为cＤＮＡ推导的氨基酸序列提供证据；③为重组DNA产生的蛋白质做出指纹分析；④蛋白质的完整结构鉴定；⑤确定翻译后修饰的位点