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动物源大肠杆菌耐药基因与HPI毒力基因的检测及相关性分析-营养与食品卫生学专业论文
摘 要
大肠杆菌(Escherichia coli)是一种重要的能引起食源性疾病的人畜共患病原菌, 随着抗菌药物的滥用,大肠杆菌耐药性情况日益严重,而细菌的耐药性可通过多种途 径进行传播,引起交叉耐药,严重威胁着人类的健康。耶尔森菌强毒力岛(high pathogenicity island, HPI)通过夺取宿主中的铁元素来增强细菌在宿主体内存活的机 率,进而加重对机体患病的感染能力,毒力岛的发现和研究,对深入了解细菌性疾 病的发生、发展过程以及对疾病的预防控制都有着深远影响。
以大肠杆菌耐药基因和 HPI 标志性基因为研究对象,设计特异性引物,采用 PCR 技术对两类基因进行特异性扩增,通过反应条件和反应体系的优化,建立大肠杆菌 ESBLs 耐药基因(TEM、SHV)和 HPI 毒力基因(irp1、irp2、fyuA)的双重 PCR 检测方法,并对大肠杆菌中耐药基因和 HPI 毒力基因之间的相关性进行了分析。 具体研究内容和结果如下:
1、动物源大肠杆菌分离株耐药表型的检测
采用 NCCLS 推荐的 K-B 法来检测大肠杆菌分离株(猪源 25 株、鸡源 12 株) 对 20 种抗菌药物的耐药性,以大肠杆菌 ATCC 25922 为药敏质控菌,记录并分析实
验结果。
猪源大肠杆菌分离株对于常见的抗菌药物阿莫西林(24/25,96%)、苯唑西林
(23/25,92%)、氨苄西林(22/25,88%)、羧苄西林(21/25,84%)、阿莫西林/棒 酸(21/25,84%)、氯霉素(23/25、92%)表现出很强的耐药性(≥80%)。
鸡源大肠杆菌分离株对于兽医临床中常见的抗菌药物苯唑西林(12/12,100%)、 氨苄西林(11/12,91.7%)、羧苄西林(11/12,91.7%)、阿莫西林(9/12,81.8%)、
阿莫西林/棒酸(9/12,81.8%)表现出很强的耐药性(≥80%)。 其次猪鸡源大肠杆菌对链霉素(18/25,72%、7/12,63.6%)、强力霉素(19/25,
76%、6/11,54.5%)、复方新诺明(14/25,56 %、7/11,63.6%)、诺氟沙星(13/25,
52%、7/11,63.6%)表现出较强的耐药性(50%~80%)。大肠杆菌分离株呈现出多 重耐药,其中对 8~14 种抗菌药物具有多重耐药性的菌株占总分离株 73.0%(27/37)。 该结果对于大肠杆菌分离株中的耐药性做了一个初步的检测分析,为后续基因型试
验提供基础数据。
2、动物源大肠杆菌分离株耐药基因和HPI毒力岛基因的PCR检测 以大肠杆??耐药基因与HPI毒力岛基因作为研究切入点,根据GenBank中已发表
的大肠杆菌标志性基因序列,分别设计合成了大肠杆菌耐药基因TEM、SHV、OXA、
I
cmlA、floR、sul-I、sul-II、tetA、tetB、aac(3)-II、aph(3’)-II和毒力岛irp1、irp2、fyuA
等14对特异性引物,提取大肠杆菌DNA作为模板,对大肠杆菌耐药基因和HPI毒力 岛基因进行PCR检测,并对PCR扩增反应条件进行优化。结果表明,大肠杆菌耐药
基因和HPI毒力岛基因引物TEM、SHV、OXA、cmlA、floR、sul-I、sul-II、tetA、tetB、
aac(3)-II、aph(3’)-II、irp1、irp2和fyuA能扩增出目的片段,大小分别是118、132、190、 467、601、925、179、344、388、412、232、799、414、948bp。
通过优化后的 PCR 反应条件和反应体系对所有大肠杆菌分离株的耐药基因和
HPI 毒力基因进行了检测,为建立双重 PCR 同时检测以上两类基因提供数据和理论 基础。
3、动物源大肠杆菌ESBLS耐药基因和HPI毒力基因双重PCR检测及相关性分析 在单重PCR反应条件和反应体系优化的基础上,对双重PCR反应条件和反应体
系中的引物浓度和Tm值进行优化。检测结果显示,检出irp1+TEM、irp1+SHV、
irp2+TEM、irp2+SHV、fyuA+TEM、fyuA+SHV基因的阳性率分别为13.5 %、13.5 %、 21.6 %、21.6 %、16.2 %、16.2 %。在大肠杆菌中扩增出118、132、799、414、948
bp的特异性目的条带,而甲型副伤寒沙门氏菌、绿脓假单胞菌、肺炎克雷伯菌中则
不能扩增出。灵敏度试验表明,该反应体系的检测灵敏度为1.5×103 CFU/mL。irp2缺 失株试验表明,irp2中仍能检测出TEM、SHV、sul II、aac(3)-II、cmlA、floR基因。
大肠杆菌中ESBLs耐药基因和HPI基因通过双重PCR方法均能特异检测出,缺失株试
验证实两类基因
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