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利用SSR标记鉴定棉花品种与纯度研究进展 　　摘要：概述了SSR标记在棉花（Gossypium spp.）的指纹图谱构建、遗传多样性分析、品种纯度检测、品种间差异性相关分析等方面的研究进展，并对其应用前景进行了展望，旨在为今后的研究提供借鉴。 　　关键词：棉花（Gossypium spp.）；SSR标记；品种；纯度 　　中图分类号：Q503；S562 文献标识码：A 文章编号：0439-8114（2013）09-1992-03 　　棉花是中国重要的经济作物，高产、优质新品种的选育在棉花产业发展中至关重要。目前，杂交棉花品种在生产上居主导地位，优良的抗虫杂交棉花品种是农民增产增收的基础。大多数优势杂交棉花品种是通过人工去雄制种，制种过程中，母本因去雄不彻底或漏去雄易形成自交铃，这将严重影响杂交种纯度。如果不及时准确地进行鉴定，则会给棉花生产带来严重的损失。因此，杂交棉花品种快速、准确而高效的纯度检测，对于杂交棉花品种的推广应用意义重大[1]。棉花品种纯度的检测方法有种子形态学、幼苗鉴定、蛋白质电泳以及田间小区种植鉴定等方法[2]。随着分子生物学的发展，各种基于DNA的新型分子标记的出现推动了DNA指纹图谱技术的快速发展。DNA指纹图谱的多态性反映了基因组DNA间的差异，这种差异受环境影响较小、数量多，具有高度的个体特异性。SSR即简单序列重复，又称微卫星DNA，是一类由几个核苷酸为重复单位组成的简单串联重复序列。由于SSR多态性丰富，而且覆盖整个基因组的编码区和非编码区，成为一种新兴分子标记[3]。棉花基因组中存在着丰富的SSR标记，SSR标记以其独特的优势，已被广泛用于棉花的遗传图谱构建、目标基因定位、遗传多样性分析、种质鉴定及分子标记辅助选择等方面的研究。本文概述了利用SSR标记鉴定棉花品种和纯度的研究进展，皆在为今后的研究提供一定参考。 　　1 SSR标记鉴定不同棉花品种 　　2001年武耀廷等[4]用48对SSR引物对30个棉花常规品种、4个杂交品种及其亲本进行了多态性筛选。结果表明，有27对引物检测到了多态性，SSR3442、SSR2495、SSR3347和SSR1231引物能够将湘杂2号、皖杂40、中棉所28、南抗3号及亲本等30个常规品种区分开来，并用SSR标记对栽培品种、杂交品种及亲本进行了多态性筛选，然后根据栽培品种及亲本SSR指纹图谱的差异，建立了棉花杂交品种的特征指纹图谱，应用于杂交品种的分子鉴定和纯度检测。朱美霞等[5]应用引物组合法，对86-1号、冀棉668、新棉99B、中棉19及中棉12进行了纯度分析，用特性好的引物J120、J108、J182进行三重引物组合对5个品种的250个单株进行检测。结果表明，三重引物组合不仅可以快速检测棉花品种的纯度而且可以减少试验工作量。张玉翠等[6]以中国3大棉区8个棉花主产省（自治区）的32个棉花主栽品种为材料，利用SSR标记进行DNA指纹图谱的构建和遗传多样性分析。结果表明，长江流域棉区品种间差异最大，黄河流域棉区次之，新疆棉区最小，常规棉种遗传基础相较于杂交棉种的遗传基础窄。 　　2 SSR标记鉴定棉花品种纯度 　　棉花是常异花授粉作物，其杂交制种容易发生混杂。为了鉴定棉花品种纯度，刘勤红等[3]以转基因抗虫杂交棉鲁棉研15号母本、父本及其F1代为材料，通过筛选217对棉花异源四倍体的SSR引物，获得了十几个区分鲁棉研15号亲本及其F1代的标记位点，为鲁棉研15号杂交种的纯度鉴定提供了方法。但该方法不能将鲁棉研15号与其他杂交组合区分开，因为还需要对其亲本进行指纹分析，只有获得了双亲特异的分子标记，才能够对该品种进行指纹分析，从而鉴定出假冒种子。殷剑美等[1]利用美国Research Genetics公司设计的217对专用微卫星引物，以苏杂118及其母本、父本为材料，筛选出12对具有多态性的引物，其中7对引物在两亲本间扩增出大小不同的条带，均在F1代中表现为杂合带共显性标记，并构建了苏杂118的SSR指纹图谱，可将苏杂118与其他杂交组合区分开，还可有效区分苏杂118两亲本和杂交F1代的基因型，从而进行种子纯度检测。为进一步研究棉花SSR指纹图谱，潘兆娥等[7]以杂交棉品种中棉所48及其母本、父本和高世代自交系陆地棉TM-l为材料，利用25对核心引物对中棉所48及其亲本进行多态性筛选，共16对引物在两亲本间具有多态性，其中，14对引物在两亲本间扩增出大小不同的条带，均在F1代中表现为杂合带共显性标记。用不同材料扩增得到的二进制数据转换成十进制数据，构建了杂交棉中棉所48的数字指纹图谱，为该品种的真伪鉴定和纯度检测提供了方法。 　　3 SSR标记鉴定棉花品种应用研究 　　为进一步研究SSR标记技术在棉花品种纯度鉴定中的可行性、可靠性和科学性，科