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土壤细菌群落密度实时荧光定量PCR检测体系的建立
1 2 Vol. 1，No. 2
第 卷第 期 土 壤 与 作 物
2012 6 SOIL AND CROP Jun. ，2012
年 月
土壤细菌群落密度实时荧光定量PCR 检测体系的建立
1，2 1 1，3 4
， ， ，
顾 卿 许艳丽 魏 巍 刘 爽
(1. ， ，
中国科学院东北地理与农业生态研究所黑土区农业生态院重点实验室 海伦农田生态系统国家野外观测研究站
150081 ;2. ， 150040 ;3. ， 100049 ;
黑龙江哈尔滨 东北林业大学 黑龙江哈尔滨 中国科学院研究生院 北京
4. ， 100085)
中国科学院生态环境研究中心 北京
: ， P1 P2 ，
摘 要 为了建立土壤环境样品中细菌群落的定量分析体系 选用了多环芳烃污染土壤处理 和 以及无多环芳烃污
C 3 ， ， PCR
染的裸地生态系统土壤 等 种处理 利用构建克隆子的方法制作标准样品 并对实时荧光定量 标准曲线的线性
2 2
(R )、 (E) (S) 。 ， R = 0. 985 、 E =
扩增效率 以及斜率 等相关参数进行了优化 结果表明 标准曲线的线性 扩增效率
101. 7 % S = － 3. 282 ， 。 P1、P2 C 16S rDNA 1. 4 × 109
以及斜率 均符合参数符合要求 土壤样品 和 的细菌 片段拷贝数为
个·g － 1 、4. 0 × 109 个·g － 1 和5. 0 × 109 个·g － 1 。说明建立的实时荧光定量PCR 检测体系可以灵敏地定量未知模板的土壤细菌数
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