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非水溶性药物潜在靶蛋白筛选方法探索

中国科学: 化学 2011 年 第41 卷 第6 期: 976 ~ 981 SCIENTIA SINICA Chimica SCIENCE CHINA PRESS 快报 非水溶性药物潜在靶蛋白筛选方法探索 ①② ①② ①② ①* ① ① 陶定银 , 夏思敏 , 刘晋湘 , 张丽华 , 梁振 , 张玉奎 ① 国家色谱研究分析中心; 中国科学院大连化学物理研究所分离分析化学重点实验室, 大连 116023 ② 中国科学院研究生院, 北京 100039 *通讯作者, E-mail: lihuazhang@ 收稿日期: 2011-01-05; 接受日期: 2011-04-28 doi: 10.1360/032011-19 摘要 针对化学蛋白质组学在筛选非水溶性药物的靶蛋白中存在的问题, 建立了以非 关键词 水溶性药物颗粒为载体的靶蛋白筛选方法. 通过避免药物固定化, 不仅可以保留全部的 地塞米松 化学蛋白质组 药物官能团, 而且减少了蛋白质在固载基质上的非特异性吸附, 可提高获得数据的可信 药物靶蛋白 度. 将非溶性药物地塞米松颗粒直接与人小细胞肺癌H446 细胞提取蛋白质通过间歇性振 非水溶性药物 荡孵育 24 h, 然后采用缓冲液清洗药物颗粒, 最后对药物颗粒特异性结合的蛋白质进行 酶解和分离鉴定. 结果表明, 筛选出41 个潜在的药物靶蛋白, 参与了与DEX 药物作用机 理相关的多种蛋白质代谢通路和糖代谢通路, 同时还发现部分蛋白质参与了帕金森症疾 病过程. 1 引言 导致药物和蛋白质相互作用的几率下降. 在基于亲 和色谱方法中, 小分子化合物被固载于固定相表面, 药物蛋白靶点分析对于阐明生理或病理过程的 对与其具有相互作用的蛋白质进行选择性富集. 这 发生、发展与调控机制、研究药物作用原理、评估药 种方法虽然通常选择亲水性好、机械强度高的固定相 物安全性、进行新药研发以及进一步改善治疗手段等 作为药物载体, 但是固载时占用的药物基团可能是 具有重要意义. 随着人类基因组学和蛋白质组学的 药物与蛋白质的作用靶点. 另外载体对蛋白质产生 发展, 人们认为潜在的药物蛋白靶点可能在 3000~ 的不可避免的非特异性吸附会降低分析结果的可靠 10000 个之间, 而这些数目还不包括后翻译修饰蛋 性, 同时也存在间隔臂带来的问题. 因此, 发展新型 白、蛋白异构体以及变异蛋白. 然而目前已发现的 化学蛋白质组技术用于提高靶蛋白筛选的准确度具 药物靶点蛋白不到500 个[1]. 因此, 为了发现更多潜 有重要意义. 在的药物靶点蛋白质, 发展高通量药物靶点筛选新 地塞米松(Dexamethasone, DEX), 具有抗炎、抗 方法非常重要. 内毒素、抑制免疫、抗休克及增强应激反应等药理 化学蛋白质组学技术主要用于研究复杂蛋白质 作用[5], 而且也有报道 DEX 在帕金森症疾病中的应 组体

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