宗地花猪GDF9基因多态性和繁殖性状关联性分析.docVIP

宗地花猪GDF9基因多态性和繁殖性状关联性分析 　　摘要：为验证GDF9基因SNP位点与宗地花猪繁殖性状的关联性，从而为提高宗地花猪繁殖性能提供有价值的分子辅助标记，推进选育进程进行试验。以贵州宗地花猪经产母猪为试验素材，利用DNA池和DNA直接测序方法检测GDF9基因的多态性，对各突变位点不同基因型个体与总产仔数、产活仔数、仔猪平均初生质量和母猪泌乳力性状进行关联性分析。在受试群体中，发现基因GDF9有2个突变位点，C1009T和T1014C均位于exon2；且都与经产母猪总产仔数、产活仔数差异显著（PABAA、DDCDCC，母猪泌乳力基因型个体之间差异不显著（P0.05）。仔猪平均初生质量的基因型表现为BBABAA、DDCDCC，差异显著（P0.05）；母猪总产仔数DD基因型多于DC与CC基因型，DD基因型为优势基因型，D为优势等位基因；BB基因型在总产仔数、产活仔数的繁殖性状中多于基因型AB、AA，BB为优势基因型，B为优势等位基因。因此，研究结果表明推测等位基因D和等位基因B可能为宗地花猪总产仔数、产活仔数的有利等位基因，且DD基因型和BB基因型为有利基因型。 　　关键词：宗地花猪；GDF9基因；SNP位点；繁殖性状；关联性分析 　　中图分类号： S828.3 文献标志码： A 文章编号：1002-1302（2017）19-0224-04 　　收稿日期：2017-07-10 　　基金项目：贵州省农业动植物育种专项资金（编号：黔农育专字[2016]009号）。 　　作者简介：林鹏飞（1991―），男，山东乳山人，硕士研究生，研究方向为动物种质资源创新。E-mail：1124800190@。 　　通信作者：燕志宏，教授，研究方向为动物遗传育种与种质资源创新。E-mail：yzh611127@。 生长分化因子9（growth differentiation factor 9，GDF9）是转化生长因子β（transforming growth factor β，TGF-β）超家族中的成员。卵母细胞是GDF9的最初来源，在大部分动物中，仅在动物卵巢的卵母细胞中检测到GDF9 mRNA和蛋白质[1-4]。在一些灵长类动物中，GDF9 mRNA和蛋白质在卵母细胞及其邻近的颗粒细胞中也有发现[5]。但研究发现GDF9可通过自分泌和旁分泌的方式，参与调节卵泡的发育和衰退，进而对优势卵泡的选择及闭锁卵泡的形成产生影响[6]。GDF9特殊性在于GDF9仅有6个Cys，而一般的TGF-β家族成员具有7个或者9个[7]，GDF9基因位于常染色体上，人的GDF9基因在5号常染色体上，而猪的GDF9基因则定位于2号染色体上[8-9]。研究发现在羊的原始卵泡中有GDF9基因的mRNA表达，一旦原始卵泡的卵母细胞产生GDF9，卵泡就开始发育[10]。Li等通过观察猪卵母细胞不同时间GDF9基因的表达时发现，GDF9在不成熟的卵母细胞中高度表达，在成熟的卵母细胞中逐渐减少[11]。于佐卿等以陶滩寒杂种羊和德滩寒杂种羊为研究对象，发现GDF9基因多态性对羊羔初生质量无显著影响[12]。由此可推测，GDF9基因对动物的生殖功能具有重要的调节作用。 　　宗地花猪是贵州省优良地方猪种之一，皮厚而糯、肉嫩味香，为人们所喜爱。但饲养周期长、产仔数少、生产效率低、成本高、养殖投入高、收益低等原因使得宗地花猪养殖群体规模?l展缓慢。针对宗地花猪的保种选育，相关机构和学者做了很多研究，推进了宗地花猪的开发利用。冯文豪等对宗地花猪的胴体肉质性状进行测定，结果显示虽然宗地花猪瘦肉率明显低于大白猪，但是肉质性状优于大白猪[13]。随后，张芸等分别研究了不同饲养方式对宗地花猪的胴体和肉质性状影响和不同饲养方式下宗地花猪肌肉营养成分及品质的影响[14]。燕志宏等研究宗地花猪1世代的生长发育情况，随后在2011年研究了宗地花猪及其与长白猪和大白猪的杂种一代猪哺乳期和保育期的生长性能[15]。毛同辉等对对产区保种选育基础群进行了繁殖性能测定，随后开始对宗地花猪繁殖性能进行了研究[16]。随着分子生物学的蓬勃发展，燕志宏等[17-20]、魏小红等[21]、李平等[22]、顾丽菊等[23]、任丽群等[24]和闫雷等[25]分别对影响宗地花猪肉质和繁殖性状的一些相关基因进行了研究，取得了一定的研究成果。本试验旨在验证GDF9基因SNP位点与宗地花猪繁殖性状的关联性分析，从而为提高宗地花猪繁殖性能提供有价值的分子辅助标记，推进选育进程进行试验。 　　1 材料与方法 　　1.1 试验动物样本 　　66头宗地花猪经产母猪来自贵州紫薇畜牧业开发有限公司宗地花猪饲养场，各头母猪均健康，在相同的饲养环境和管理条件下进行饲养，用耳缺钳采取每头母猪耳根边缘耳组织，放入装有浓度为70%