番鸭基因多态性和羽毛相关性分析.docVIP

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番鸭基因多态性和羽毛相关性分析

番鸭基因多态性和羽毛相关性分析   摘要:为探讨黑素皮质素受体1(melanocortin-1 receptor,简称MC1R)基因对番鸭羽色的影响,采用PCR和直接测序法对番鸭[WTBX][STBX]MC1R[WTBZ][STBZ]基因编码区进行多态性分析,比较不同羽色番鸭群体遗传参数和基因型分布卡方检验。结果表明:在番鸭[WTBX][STBX]MC1R[WTBZ][STBZ]基因编码区发现G274A、G279A、C485A突变,使第92处氨基酸由谷氨酸(E)变为赖氨酸(K),第162处的氨基酸由苏氨酸(T)变为天冬氨酸(N)。通过各个位点不同羽色番鸭群体基因型、等位基因频率的比较分析,同时结合不同群体间基因型分布卡方检测,发现在第279处的G-A突变中白羽番鸭仅有GG型,而其他3个携带大量黑羽的番鸭群体都以GA、AA型存在;同时全白番鸭与其他3个番鸭群体之间卡方值最大,推测此位点对番鸭的羽色影响较大。而从其他2个突变位点的数据分析推测,它们对番鸭的羽色几乎没有影响。研究结果为开展番鸭羽色研究和育种工作奠定了基础。   关键词:番鸭;[WTBX][STBX]MC1R[WTBZ][STBZ]基因;羽色;多态性;相关性分析   中图分类号: S834+.892 文献标志码: A   文章编号:1002-1302(2017)10-0024-03[HS)][HT9.SS]   番鸭是优良的肉鸭品种,原产于南美洲和中美洲的热带地区,具有生长速度快、瘦肉率高等特点。在我国番鸭已有200多年的养殖历史,开始以农户散养所占比例较大,现在已逐渐形成规模化养殖。除了纯白羽番鸭外,国内还有很多黑羽番鸭,白羽和黑羽交叉存在,有些有规律,如有些黑羽番鸭仅在头或翅膀部位存在白羽,其他部位均为黑羽,有些几乎全为黑羽。通过常规的育种手段想选育成全黑羽番鸭是很难的,随着分子生物学技术的发展,功能基因的作用机理也逐渐被挖掘。研究表明,禽类羽色是个多基因控制的性状,遗传复杂,基因间有显隐性、互作、上位等关系,要想准确控制番鸭的羽色是一个比较大的难题。   黑素皮质素受体1(melanocortin-1 receptor,简称MC1R)基因的编码区只含有1个外显子,不同动物可编码氨基酸的数量不同,一般长度为310个,是最小的G蛋白耦合受体,具有7个跨膜结构域[1]。它通过与内源配体促黑激素结合来促进腺苷酸环化酶的活化,提高环腺苷酸水平,激发酪氨酸酶水平的提高,导致黑色素的形成,实现对动物肤色、毛色或羽色的调控[2-3]。目前已知一些[WTBX][STBX]MC1R[WTBZ][STBZ]基因变异可引起动物黑色素形成的变化以及毛色/羽色的变异,师科荣等通过分析我国11个地方猪种和3个国外引入猪种的[WTBX][STBX]MC1R[WTBZ][STBZ]基因多态性,发现仅从[WTBX][STBX]MC1R[WTBZ][STBZ]基因上发生的突变看,我国地方猪种的毛色与引入猪种毛色分属截然不同的遗传体系,我国地方猪种的毛色属于显性黑毛色体系,而且该基因对我国地方猪种毛色的差异没有起到关键的影响作用[4]。Deng等发现[WTBX][STBX]MC1R[WTBZ][STBZ]基因一个突变位点与我国地方猪种的黑毛色有关[5]。唐贺等分析了3个地方黄牛群体和1个引进品种的[WTBX][STBX]MC1R[WTBZ][STBZ]基因编码区的变异情况发现,该基因E座位对牛的毛色有重要影响,E+和ED等位基因与黑色表型有关,而e等位基因与红色表型有关,但黄色、棕色和红色表型还与其他座位基因相关联[6]。杨永升等以丝羽乌骨鸡与明星肉鸡为亲本建立的资源家系群体鸡来检测[WTBX][STBX]MC1R[WTBZ][STBZ]基因编码区的多态性,结果发现,这些突变位点与鸡的肤色、胫色、肉色等性状有关,推测[WTBX][STBX]MC1R[WTBZ][STBZ]基因可能是鸡黑色素性状的主效基因或者与鸡控制黑色素性状的主效基因连锁[7]。[WTBX][STBX]MC1R[WTBZ][STBZ]基因A356G处的突变是控制他留乌骨鸡羽色的一个关键变异位点[8]。另外,还有很多关于动物[WTBX][STBX]MC1R[WTBZ][STBZ]基因突变的报道,但是没有与毛色/羽色进行相关分析,或者有些突变与动物毛色/羽色无关。   在此基础上,本试验拟运用PCR和直接测序技术检测不同羽色番鸭[WTBX][STBX]MC1R[WTBZ][STBZ]基因的突变位点,分析不同羽色番鸭群体[WTBX][STBX]MC1R[WTBZ][STBZ]基因的基因型频率、等位基因频率以及遗传参数等数据,为番鸭羽色研究提供参考。   1材料与方法   1.1试验动物   分别采集全黑(简称QH,指所

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