刘小龙-循环肿瘤DNA(ctDNA)检测策略及临床意义-医学课件.pptVIP

Comparison of ctDNA, CEA and imaging dynamics in individual study subjects 病人都经过多次手术和化疗 第一次手术进行局部切除时，ctDNA含量并没有降低；第二次手术完全切除时，ctDNA含量大幅下降。 ctDNA能实时显示病人体内肿瘤负荷的动态信息，以及治疗的效果（手术及化疗）。 标记扩增深度测序（TAM-Seq） 二步扩增： 预扩增：利用特异性引物进行15偱环的目标区域扩增 标签扩增：利用通用不同特性的接头标签进行二次扩增 双向重复测序：提高测序精度 突变频率检出率可达2% 敏感性和特异性高于97% 成本较低，利于临床应用 设计了48对引物去扩增TP53，EGFR，BARF，KRAS等癌症相关基因的5995bp突变区域 同时可对10个特异的癌症突变位点进行监控 用于确定多发癌症患者的复发病灶 用于监控癌症患者的肿瘤动态发展 癌症个体化深度测序 (CAPP-Seq) 该方法利用定制化的突变位点库作为”筛选器”， 对样本进行靶向捕获后再进行超深度测序（可达到10000X），其对肿瘤的ctDNA检测灵敏度更高，特异性更强，与全外显子测序等相比经济可行。 Stage I 检出率50% Stage II-IV 检出率100% 特异性可达到96% 突变检出率0.02% Selector 区域：139个