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STR片段分析技术相关知识 肖怀东 Field Application Specialist Tel: 400 820 8982 / 800 820 8982 E-mail: CNAPMsupport@ 摘要 基本概念回顾 片段分析技术原理及过程 常见影响分型因素 基本概念回顾 基本概念回顾 基本概念——染色体、DNA、基因、遗传标记、等位基因等 分子遗传标记的发展 STR概念及相关特性 双链DNA Gene 基因——能够表达出特定功能的产物，并决定生物体特定性状的一段DNA序列 常用术语 染色体——DNA的组装形式，每个人体细胞含有23对染色体 常用术语 能够稳定遗传的任何分子特征 个体间有显著差异且易于检测 可位于染色体的任意位置 遗传标记（Genetic Marker） 常用术语 基因座——遗传标记在染色体上的位置。 同源染色体——成对的两条染色体互称为同源染色体 等位基因——在同源染色体上占据相同座位上的一对等位基因。 D2S118 多态性（Polymorphism） 序列多态性，DNA在序列上的变异 长度多态性 --------AGACTAGACATT------- --------AGATTAGGCATT------- ---------(AATG)(AATG)(AATG)---------- 2 repeats 3 repeats ---------(AATG)(AATG)---------- 常用术语 分子遗传标记的发展 “If you want to understand today, you have to search yesterday.” –Attributed to Pearl Buck (/history.html) The Nobel Prize in Literature 1938 Pearl Buck 分子遗传标记的发展 1985 1990 1994 1998 2000 2002 1992 2006 1996 2004 2010 2008 2013 RFLP SNP PCR首次描述 2012 1991 STR 第一个商业化荧光复合STR试剂盒 PCR应用于办案 CODIS loci defined UK National Database launched (April 10, 1995) STR成为常规使用 Identifiler 5-dye kit and ABI 3100 首个Y-STR试剂盒 miniSTR Identifiler Direct Identifiler Plus 3500/xl Y-Direct Global Filer PGM CODIS update 参考Bulter《Forensic DNA typing》 什么是STR? 短串联重复序列（Short tandem repeat, STR）=微卫星DNA( microsatellite DNA) = 简单重复序列（simple sequence repeat , SSR) 长度多态性遗传标记，一般由 2-6个碱基的DNA重复序列组成，其长度多态性来源于重复单位拷贝数的个体差异。 常用术语 Dinucleotide Trinucleotide Tetranucleotide Pentanucleotide Hexanucleotide (CA)(CA)(CA)(CA) (GCC)(GCC)(GCC) (AATG)(AATG)(AATG) (AGAAA)(AGAAA) (AGTACA)(AGTACA) 5’TCCCAAGCTCTTCCTCTTCCCTAGATCAATACAGACAGAAGACAGGTGGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATATCATTGAAAGACAAAACAGAGATGGATGATAGATACATGCTTACAGATGCACAC 3’ = 12 GATA repeats (“12” is all that is reported) The number of consecutive repeat units can vary between people Categories for STR Markers Category Example Repeat Structure 13 CODIS Loci Simple repeats – contain units of identical length and sequence (GATA)(GATA)(GATA) TPOX, CSF1PO, D5S818, D13S317, D16S539 Simple rep