肺癌全基因组关联的研究进展.docVIP

肺癌全基因组关联的研究进展 　　[摘要] 近年来，肺癌全基因组关联研究不断在世界各地实施，研究对象从最初的单一欧洲人群到扩大至多种族多中心的人群，并逐步根据吸烟、性别、污染、药物作用等背景情况作了细分研究。近年来高密度芯片/测序技术的应用帮助研究人员发现了一系列在不同背景下，和不同肿瘤类型相关的基因位点突变，有部分有一定的健康和临床指导价值。本文对近年来肺癌全基因组关联发现的染色体遗传易感基因多态位点进行总结，作此综述。 　　[关键词] 全基因组关联研究；肺癌；遗传变异；单核苷酸多态性；基因组 　　[中图分类号] R734.2 [文献标识码] A [文章编号] 1673-7210（2017）10（c）-0034-04 　　The progress of GWAS in lung cancer research 　　YANG Xingli1 FU Yongquan1 LIU Xiaojun2 ZHANG Wei2 TAO Tao2 　　1.Bringspring Science and Technology Co.， Ltd.， Liaoning Province， Shenyang 110027， China； 2.Hangzhou Miti-Genomics Co.， Ltd.， Zhejiang Province， Hangzhou 310053， China 　　[Abstract] In the last decade， there have been numerous genome-wide association studies for lung cancer. The studies′ target population have expanded from Caucasians to multi-racial， incorporating the disease and genetic relations with environment factors， such as smoking， air pollution， gender and drug effects for deeper understandings. Through these studies， researchers discover series of genetic mutations related to different cancer types using high-density microarray and next generation sequencing technologies. Some of these mutation findings have high values in health management and clinical usages. This article systemic reviews current genome-wide association studies for lung cancer. 　　[Key words] GWAS； Lung cancer； Genetic variant； SNP； Genome 　　肺癌已成?槲夜?发病率和死亡率最高的一种癌症。据《2015中国癌症统计》显示，中国男性肺癌的发病率为50.9/10万人年，中国女性肺癌的发病率也达22.4/10万人年[1]。肺癌是环境和遗传因素共同作用的结果，80%以上的肺癌和烟草接触有关，但仅有不到20%的吸烟人发生肺癌[2]，这说明遗传因素在肺癌发病中起重要作用。因此，研究肺癌发病中涉及的生物学通路、发现肺癌相关变异位点，在预测、诊断、治疗、预后等方面具有重要临床价值。早期研究使用候选基因法[3]，一次检测一个或几个基因多态性，但单个基因上的变异对癌症的作用是微效的，肿瘤的发生是多个变异累积作用的结果[4]。为全面研究与癌症易感性相关的遗传变异，从全基因组水平对单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）进行筛选和识别的全基因组关联研究（genome-wide association study，GWAS）应运而生。 　　GWAS研究采用高通量的高密度基因芯片或测序仪，分析几十万甚至上百万个涵盖人类基因组范围的遗传变异，采用较大的病例-对照研究样本量，发现与疾病相关的阳性位点，再以独立的验证和筛选得到与该疾病关联最为密切的易感性点。迄今为止，利用GWAS已经发现了一些与肺癌相关联的疾病易感基因、区域和位点。为进一步研究肺癌的遗传机制，笔者特对肺癌GWAS研究进展作一综述。 　　1 易感人群 　　1.1 欧洲人群 　　自2008年起，有多个肺癌