利用AFLP分子标记技术构建花莲核心种质资源-中国农业科学.PDF

中国农业科学 2011,44(15):3193-3205 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2011.15.015 利用AFLP 分子标记技术构建花莲核心种质资源 杨 美，付 杰，向巧彦，刘艳玲 （中国科学院武汉植物园水生植物与流域生态重点实验室，武汉430074 ） 摘要：【目的】构建花莲核心种质，以利于对花莲种质资源的保存、研究和利用。【方法】利用AFLP 分子标 记，对 395 份花莲原始种质按照种属来源分组后采用组内简单比例法和聚类抽样法建立候选核心种质，比较不同 候选核心种质的多态性位点数、多态性位点百分率、观测等位基因数、有效等位基因数、Nei’s 遗传多样性指数和 Shannon’s 信息指数等参数，最终确定花莲核心种质，并进行核心种质与原始种质的遗传多样性比较和t 检验。 【结果】所获得88 个品种的花莲核心种质包括60 份中国花莲品种，3 份美洲黄莲，16 份中美杂交莲和9 份日本 莲品种。核心种质保留了原始种质22.27%的样品，多态性位点和多态性位点百分率保留率为99.27%，观测等位基 因数、有效等位基因数、Nei’s 遗传多样性指数、Shannon’s 信息指数的保留率分别为100.00%、101.72%、110.00%、 106.67%。t 测验结果表明，核心种质的遗传多样性指数与原始种质差异不显著。【结论】根据聚类分析结果剔除 原始种质中的冗余种质后，建立的核心种质以最少的花莲资源可代表原始种质最大的遗传多样性。本文所构建的 花莲核心种质在遗传上能最大程度地代表原始种质资源。 关键词：花莲；AFLP；种质资源；遗传多样性；核心种质 The Core-Collection Construction of Flower Lotus Based on AFLP Molecular Markers YANG Mei, FU Jie, XIANG Qiao-yan, LIU Yan-ling (Key Laboratory of Aquatic Plant and Watershed Ecology, Wuhan Botanical Garden, Chinese Academy of Sciences, Wuhan 430074) Abstract: 【Objective 】 The construction of the core collection is very important for preservation, study and application of flower lotus (Nelumbo Adans.) germplasm resources. 【Method 】 Based on AFLP markers, candidate core collections were constructed by using proportional strategy and UPGMA clustering sampling method within subgroups after dividing 395 flower lotus germplasm into 4 subgroups. By comparison of the genetic diversity parameters of these candidate core collection, such as the number of polymorphic loci, percentage of polymorphic loci, observed number of alleles, effective number of alleles, Nei’s gene diversity and Shannon’s information index