肝细胞癌外周血全基因表达谱的初步分析-肿瘤学专业论文.docxVIP

汕头 汕头大学医学院硕士学位论文 万方数据 万方数据 学位论文知识产权声明 本人在就读研究生期间所完成的学位论文以及相关结果，知识产权归属 汕头大学医学院。本人在毕业离校前会将有关的研究资料和结果全部上交导 师，离校后发表或使用学位论文或与学位论文直接相关的学术论文或成果时， 须征得导师及导师所在单位的同意，并要求署名单位仍为汕头大学医学院。 本人不得以本论文的研究成果申报研究课题。导师和导师单位可以将学位论 文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描 等复制手段进行保存、汇编学位论文，可以公布（包括刊登）论文的全部或 部分内容。导师及导师所在单位享有发表学位论文、申请成果和专利的权利。 注：保密的学位论文在解密后适用本声明。 研究生签名： 日期： 2014 年 5 月 22 日 导师签名： 日期： 2014 年 5 月 22 日 中文摘要 目的 对肝细胞癌与健康对照的外周血全基因表达谱进行检测，分析筛选其差异表达基因。 材料与方法 应用 Affymetrix 基因芯片技术平台的人类全基因表达谱芯片技术，检测 15 例临床确 诊的肝细胞癌患者和 15 例年龄、性别等相匹配的健康人的外周血基因表达谱，利用 Gene Spring 11.0 软件采用 t-test unequal unpaired 算法，计算 P＜0.05 时的差异表达基因并按差异 倍数排序，利用 Gene Spring 软件及 DAVID Bioinformatics Resources 6.7 对前期筛选的差异 表达基因进行聚类分析，GO 分析和 Pathway 分析。 结果 基因表达谱芯片分析发现 597个有显著差异表达的探针组（差异倍数≥2倍，P0.05）， 共涉及434个基因，其中95个基因在肝癌患者外周血中表达显著上调，339个基因表达显著 下调。在肝癌患者中表达上调的基因主要与蛋白质代谢过程、离子转运等生物学过程有关， 主要参与核糖体的翻译通路、氧化磷酸化通路等。表达下调的基因主要与细胞大分子代谢 过程、生物合成过程的调控等有关，主要参与T细胞受体信号通路、自然杀伤细胞介导的 细胞毒作用通路等。 结论 用全基因组表达谱芯片可以筛选出肝细胞癌与健康对照外周血中的差异表达基因，这 些基因可为开发肝癌无创诊断技术奠定基础。 关键词 肝细胞癌；外周血；基因表达谱；基因芯片 I 万方数据 万方数据 Abstract Objectives We detect the whole genome expression profiles between hepatocellular carcinoma(HCC) patients and healthy control, and screen differential expression genes. Materials and Method We applied the human whole genome microarray of the Affymetrix gene chip technology platform, to detect the whole genome expression profiles of peripheral blood of 15 HCC patients and 15 health control individuals matched at age and gender. Using t-test unequal unpaired algorithm of Gene Spring 11.0 software to calculate differentially expressed genes when P0.05 and sort by fold change. Gene Spring software and DAVID Bioinformatics Resources 6.7 were used for clustering, GO analysis, Pathway analysis. Result The results shew that there were 597 significantly differential expression probe sets (fold change larger than 2 and P less than 0.05), which is involved 434 genes. 95 genes of them were significantly up-regulated and 339 genes were significantly down-reg