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肝细胞肝癌乙肝病毒基因整合位点及临床病理分析-外科学(普外科)专业论文
安徽医
安徽医科大学硕士学位论文
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BLAST
basical local alignement search tool
基本局部比对搜索工具
bp
base pair
碱基对
DNA
deoxyribonucleic acid
脱氧核糖核酸
dNTP
deoxyribonucleside triphosphate
三磷酸脱氧核糖核苷
EB
ethidium bromide
溴化乙锭
EDTA
ethylene dinitrilotetracetic
乙二胺四乙酸
HBsAg
hepatitis B virus surface antigen
乙肝病毒表明抗原
HBV
hepatitis B virus
乙型肝炎病毒
HCC
hepatocellular carcinoma
肝细胞癌
PCR
polomerase chain reaction
聚合酶链反应
rpm
rations per minute
每分钟转速
Tm
UDG
melting temperature
uracil DNA glycosylase
DNA 解链温度
尿嘧啶 DNA 糖基化酶
肝细胞肝癌乙肝病毒基因整合位点及临床病理分析
中文摘要
目的 探讨乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus ,HBV)在肝细胞肝癌(hepatocellular carcinoma ,HCC)染色体上的整合规律及其与临床病理参数的关系。
方法 收集安徽医科大学第一附属医院肝胆外科 2011 年 1 月~2012 年 2 月共 40 例 HBsAg 阳性 HCC 患者围手术期的一般临床资料和病理学资料,并进行术后随 访。以 40 例 HCC 组织的 DNA 为模板,HBV X 基因上游序列和人类基因组 Alu 重复序列为引物,应用巢式 PCR 原理,扩增出 HBV X 基因及其侧翼的人基因组 DNA 片段。PCR 产物进行全自动测序。所获结果经美国国家生物技术信息中心
(NCBI) BLAST 及 Mapviwer 检索确认 HBV 整合在染色体上的精确位置。结 合临床病理参数及随访资料分析 HBV DNA 整合对 HCC 患者的影响。应用 Kaplan-Meier 分析 HBV DNA 整合组以及未整合组患者术后的无瘤生存率及总体 生存率。Cox 回归单因素及多因素分析影响 HCC 患者术后生存的因素。
结果 40 份 HCC 组织中,18 例存在 HBV 整合现象,另 22 份标本未检测到有 整合。整合的标本中 15 例正向插入宿主基因,7 例反向插入宿主基因,其中 4 例既有正向插入,又有反向插入,2 例有两个 HBV 整合位点。其中 4 个基因(homo sapiens telomerase reverse transcriptase、mixed-lineage leukemia 4、cyclin E1 和 SUMO specific protease 5)发现被 HBV 重复整合,从病毒基因分析,整合可发 生于 X 基因的任意长度,且均以截短方式插入宿主细胞 DNA。HBV 整合与 HCC 患者在性别、年龄、AFP、镜下癌栓、脉管侵犯、包膜、子灶及复发等方面无关
(P0.05);而与 HBeAg 阳性、HBV DNA 水平、肿瘤大小、分化程度呈正相关
(P0.05)。全组病例随访时间 3 月~35 月,平均 17.2±7.6 月,整合组平均总 体生存时间为低于未整合组(14.0±5.8 月 vs 19.8±8.1 月),整合组 1、3 年总 体生存率低于未整合组(77.7% vs 86.4% 、72.2% vs 81.8%), 1、3 年无瘤生存 率 亦 低 于 未 整 合 组 (66.7% vs 86.4% 、 55.6% vs 63.6%) , 均 无 统 计 学 意 义
(P0.05)。
结论 HBV 在 HCC 细胞染色体上存在整合且为不均衡分布。HBV 整合与 HCC 患者 HBeAg 阳性、HBV DNA 水平、肿瘤大小以及分化程度呈正相关,且影响 HCC 患者术后总体生存时间、无瘤生存率和总体生存率。HCC 术后复发为影响 HCC 患者术后生存的独立危险因素。
关键词 肝肿瘤 / 乙型肝炎病毒 / 病毒整合
Identification of Hepatitis B Virus Integration Sites in Hepatocellular Carcinoma Tissues from Patients and its Relationship with Clinicopathological Parameters
Abstract
Ob
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