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属级芯片筛查技术在马铃薯纺锤块茎类病毒属检测中的应用
514 生 物 工 程 学 报 张永江 等/属级芯片筛查技术在马铃薯纺锤块茎类病毒属检测中的应用
Chinese Journal of Biotechnology
/cjbcn March 25, 2014, 30(3): 514−523
DOI: 10.13345/j.cjb.130329 ©2014 Chin J Biotech, All rights reserved
生物技术与方法
1 1 1 2
张永江 ，辛言言 ，朱水芳 ，邓丛良
1 100029
2 101312
, , , . . , 2014,
30(3): 514−523.
Zhang YJ, Xin YY, Zhu SF, et al. Application of screening microarray technology in genus level for detection of Pospiviroid.
Chin J Biotech, 2014, 30(3): 514−523.
摘 要: 建立马铃薯纺锤块茎类病毒属 (Pospiviroid) 类病毒有效的芯片筛查技术，对该属类病毒进行筛查。
分析了该属类病毒序列，得到 19 条具有属级鉴定特征的探针。这些探针符合GC 含量在40%与60%之间、单
个核苷酸含量不大于 50% 、无多于4 个核苷酸的连续重复及不形成多于 6 个核苷酸的发卡结构的标准；将探
针点制到玻璃片基上制备芯片。芯片探针有效性实验结果表明，菊花矮化类病毒 (Chrysanthemum stunt viroid,
CSVd) 及番茄雄性株类病毒 (Tomato planta macho viroid, TPMVd) 样品杂交可获得有效信号；灵敏度实验结
果表明，该芯片可检测到200 pg/μL 的总RNA 。该芯片可用于Pospiviroid 类病毒的筛查。
: 马铃薯纺锤块茎类病毒属，属级探针，芯片，菊花矮化类病毒，番茄雄性株类病毒
Application of screening microarray technology in genus
level for detection of Pospiviroid
1 1 1 2
Yongjiang Zhang , Yanyan Xin , Shuifang Zhu , and Congliang Deng
1 Chinese Academy of Inspection and Quarantine, Beijing 100029, China
2 Inspection and Quarantine Testing Center of Beijing Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau, Beijing 101312, China
Abstract: The aim was to establish an effective screening microarray at genus level for Pospiviroid. We analyzed
Received: July 4, 2013; Accepted: August 9, 2013
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