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高加索人群银屑病易感位点与中国汉族人寻常型银屑病相关性分析-皮肤病与性病学专业论文
安徽医
安徽医科大学硕士学位论文
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HYPERLINK \l _bookmark0 3.1 研究对象一般情况 25
HYPERLINK \l _bookmark1 3.2 等位基因及等位基因-表型分析结果 27
HYPERLINK \l _bookmark2 3.2.1 RS2066808 等位基因及等位基因-表型分析结果 27
HYPERLINK \l _bookmark3 3.2.2 RS280519 等位基因及等位基因-表型分析结果 28
HYPERLINK \l _bookmark4 3.3 基因型与基因型-表型分析结果 33
HYPERLINK \l _bookmark5 3.3.1 RS2066808 基因型与表型分析结果 33
HYPERLINK \l _bookmark6 3.3.2 RS280519 基因型与表型分析结果 34
HYPERLINK \l _bookmark7 4. 讨论 35
HYPERLINK \l _bookmark8 5. 结论 37
HYPERLINK \l _bookmark9 6. 参考文献 37
HYPERLINK \l _bookmark10 附 录 41
HYPERLINK \l _bookmark11 致 谢 42
HYPERLINK \l _bookmark12 课题综述 44
HYPERLINK \l _bookmark13 欧美人群与中国汉族人群共同的银屑病易感基因研究进展 44
英文缩写词表
缩写词
GWAS
英文名称
Genome-wide association study
中文名称
全基因组关联研究
PV
Psoriasis vulgaris
寻常型银屑病
OMIM
SNP
Online Mendelian Inheritance in Man
Single Nucleotide Polymorphism
人类孟德尔遗传在线 单核苷酸多态性
HGP
Human Genome Project
人类基因组计划
HapMap
Human Haplotype Map
人类基因组单体型图
STAT2 Signal Transducer and Activator of
Transcription 2
信号传导与激活因子 2
SPSS Statistic Package for Social Science 社会科学统计软件包
PCR Polymerase chain reaction 多聚酶链反应
SAP Shrimp alkaline phosphatase 虾碱酶
OR Odd Ratio 优势比
95%CI 95% Confidence interval 95%可信区间
中文摘要
高加索人群银屑病易感位点与中国汉族人寻常型银屑 病相关性研究
研究背景 银屑病(psoriasis, OMIM # 177900)是一种常见的慢性复发性炎症性皮 肤病,影响了全球1%~3%的人口,具有明显的遗传异质性和种族差异性。在汉族 人群中银屑病的发病率约为0.123%,且以寻常型最多见(占患者总数的90%以上)。 银屑病的发病机制尚未完全明确,目前多认为该病由遗传、环境及自身免疫性因 素共同作用致病。近年来,随着全基因组关联研究(GWAS)的开展,人们对银 屑病易感基因的探索也不断深入,发现了很多与银屑病发病相关的易感位点,包 括 MHC 区域 , IL12B, IL23A, IL23R, TNFAIP3, IL-13/IL-4, TNIP1, LCE 基因簇 ,
TRAF3IP2, ERAP1, PTTG1, CSMD1, GJB2, SERP1NB8, ZNF816A, NOS2, FBXL19,
NFKBIA, IL28RA, REL, IFIH1和TYK2等。最近欧洲人群的几项GWAS研究发现, STAT2, TYK2, YDJC, REL, ZMIZ1和PRDX5基因与银屑病发病具有相关性,但其与 汉族人群银屑病的相关性研究目前国内外尚未见报道。
目的 1. 通过对欧洲人群银屑病易感基因在中国汉族人群中进行基因分型,探寻 报道的欧洲人群 6 个银屑病易感基因:REL, STAT2, TYK2, YTJC, ZMIZ1 和 PRDX5 与中国汉族人群寻常型银屑病易感性的关联结果; 2. 依据获得的基因分型数据, 运用基因型-表型分析法,寻找基因型与银屑病临床亚型之间的关联性。
方法 选择 2208 例汉族人银屑病病例和 2208 例种族、地域、性别、年龄等基本 匹配的正常对照,应用 Sequenom? MassArrayTM 质谱阵列技术对欧洲人群报道的银 屑病易感 SNP 进行基因
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