dhav3 ls株遗传变异分析 vp1蛋白表达及荧光定量pcr型方法的建立
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位氨基酸区段的可能性最大,同时这些位点也是最易变异的位点。针对高
位氨基酸区段的可能性最大,同时这些位点也是最易变异的位点。针对高 变区选取的第132.240位氨基酸区段得到成功表达,纯化的融合蛋白分子量 约为38ku。Western blot分析结果表明,融合蛋白能被抗GST标签鼠单克 隆抗体特异性识别,证明该蛋白具有良好的反应原性。
本研究还针对1、3型鸭甲肝病毒5端保守区设计一对特异性引物,采 用SYBR Green I荧光染料,成功建立了一种基于荧光定量PCR熔解曲线 法的DHAV分型检测方法。结果表明,建立的方法特异、快速、敏感,对 1.0x102~1.0x109 copies/I.tL浓度的模板均有较好的检测效果,最低检出量均 为100 copies4tL,是普通PCR的100倍;特异性好,排除常见禽源病毒的 干扰;对高、中、低不同浓度质粒标准品检测表现出良好重复性。利用建 立方法对DHAV-1和DHAV-3感染雏鸭后在体内组织器官的增殖规律进 行探究,发现鸭甲型肝炎病毒广泛增殖于鸭的大部分组织脏器内。两种病 毒在组织器官中的增殖规律大体一致,其中对肝脏最具有嗜性,脾脏、肾 脏、肺脏中病毒滴度也很高,进而从病毒含量角度解释了DHAV感染雏鸭 后在肝脏、脾脏、肾脏、肺脏等主要靶器官引起的特征病变。
关键词:鸭甲肝病毒分离鉴定序列分析结构蛋白VPl原核表达荧光 定量PCR
万方数据
GENETIC
GENETIC VARIATION ANALYSIS AND VP l PROTEIN EXPRESSION OF DHAV_3 LS STRAIN AND ESTABLISH姬NT
OF FQ—PCR GENOTYPING METHOD
A。B STRACT
Duck viral hepatitis(DVH)is known as an acute,highly lethal viral disease within 3 weeks old ducklings by duck hepatitis virus,seriously affecting the development of duck industry.At present,the main pathogen of DHV is the duck hepatitis A virus(DHAV)in China.Therefore,it is significant to conduct studies of DHAV isolation,genetic variation,main structural protein expression and differential diagnosis of pathogen for future research on DHAV molecular
epidemiology,pathogen detection and disease prevention and contr01.
A strain of virus,named as LS strain,was isolated and identified by duck embryo proliferation,animal regression test,ELD50 and RT-PCR method from 1 case of suspected DVH.The complete genome sequences of the isolate were amplified,cloned and analyzed.The result showed that the whole genome of LS strain was 7 8 1 5 nt in length excluding the cap structure,including 5’UTR(652
nt),ORF(6 75 6nt)and 3 UTR(3 66nt)back with at least 26A poly(A)tail LS
strain shared the highest nucleotide and amino acid homology with DHAV-3 reference strains reaching 97.4%and 99%;furthermore,LS strain and DHAV-3 C-BLZ,SD 1 20 1 strain were in the same genotype,and they might come from the same ancestor.As a result LS strain could
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