SSR分子标记技术.pptVIP

SSR标记技术 一、简介、原理 二、多态性基础 三、开发、前景 一、SSR标记 原理 简单序列重复(single sequence repeat）简称SSR s)或微卫星(m icrosatellite)序列大量地存在于大多数真核生物及部分原核生物基因组的非编码区和编码区中，由串联的1- 6 个核苷酸重复片段构成，长度一般在100bp以下，具有长度的超变性。 原理:与微卫星序列相邻的两侧区域保守性通常较高，可以在此保守区域设计一对特异的PCR引物，扩增其中的微卫星序列，通过聚内酞胺凝胶电泳，即可显示出个体间在此位点的微卫星序列的多态性。 二、SSR标记 多态性基础 目前研究过的所有植物中均存在着SSR多态性。绝大多数作物，如大豆、水稻、小麦、玉米、大麦等中，SSR位点上的等位基因数目可多达十几个乃至几十个，个别作物多态性水平较低。和其他DNA分子标记相比，单个SSR位点检测到的等位基因个数和多态性指数(diversity index，用1- E可表示，其中P为某一位点第i个等位基因)是最高的。 对人类SSR的研究表明，核心序列的重复次数与SSR的长度多态性有密切关系。重复次数增加，SSR的长度多态性增高。这一趋势也在一些作物中得到证实。不同重复类型SSR多态性水平存在