基因调控网络的分析与控制-生物医学工程专业论文.docxVIP

摘 摘 要 摘 要 基因表达和调控过程是分子生物学的核心问题。基因调控网络是系统生物 学于合成生物学研究的基本内容。大量研究结果表明：基因调控网络具有非线 性相互作用，时间滞后，正负反馈调控，以及随机噪声等一般特性。本学位论 文基于随机微分系统 Lyapunov 稳定性理论，泛函微分方程基本理论，利用 Ito?’s 微分公式，随机分析原理，Schur 余 (补)，矩阵不等式等方法，以线性矩阵不等 式为工具，研究在噪声作用下的时滞基因调控网络的稳定性与 H∞ 控制问题。 主要包括以下内容： 由于受到内噪声和外噪声的影响，基因调控本质上是一个随机过程。而噪 声会引起动力学参数的波动和不确定性和基底速率的扰动。另一方面，由于基 因调控网络中发生的不同生化反应，不可避免的会带来时滞，而且这些时滞也 受到噪声的影响。因此，首先提出一个受制于外噪声和内噪声，时变时滞的基 因调控网络模型。时变时滞假设属于一定区间而且对时变时滞的导数没有限制， 这允许时滞可以是一个快速变化的函数。利用 Ito?’s 微分公式、随机分析原理， 并利用积分不等式和自由加权矩阵方法，我们分析这类基因调控网络的具有干 扰抑制水平的鲁棒随机稳定性。基于 Lyapunov 方法，我们给出一个新的依赖时 滞上界和下界新的稳定性条件，并以线性矩阵不等式的形式表现出来。 接下来，我们来设计基因反馈控制器来保证基因调控网络均方渐近稳定， 并且能抑制噪声。其中可以根据工程要求指定控制器的结构。我们分别进行 H∞ 性能分析，然后设计 H∞ 状态反馈控制律使得系统稳定且具有给定的 H∞ 干扰抑制度 γ。基于 H∞ 控制理论，我们将控制器的设计问题转化为一个凸优 化问题，并且给出反馈增益的解析形式。这将有助于为合成生物学中的实验设 计提供理论基础。我们给出了一个三基因调控的例子来验证理论结果的可行性 和有效性。 最后，结合目前该领域的研究进展和自己所做的工作，对本文的工作做了 总结。 关键词： 基因调控网络，鲁棒稳定性，鲁棒 H∞ 反馈控制，时滞，噪声抑制 I ABSTRACT ABSTRACT ABSTRACT Gene expression and regulation processes are the core problem of molecular bi- ology. Genetic regulatory networks (GRNs) are the fundamental problem in studying systems biology and synthetic biology. A lot of experiments show that the nonlinear interactions, time delay, positive and negative regulation and inherently stochastic na- ture of gene regulatory networks. This thesis focuses on the problem of robust stability analysis and robust control for time-delayed genetic regulatory networks under noises based on Lyapunov stability theory, Ito?’s formula, Schur lemma, stochastic analysis ap- proach, and Linear Matrix Inequality approach. The main works of this thesis are as follows: Gene regulation is inherently a stochastic process due to intrinsic and extrinsic noises which cause the fluctuations and uncertainties of kinetic parameters. On the other hand, time delays are usually inevitable due to different biochemical reactions in GRNs which are also affected by noises. Therefore, in this paper, we propose a GRN model that is subject to additive and multiplicative noises as well as time