circRNA的合成与功能.PDFVIP

circRNA的合成与功能 文献翻译：林子鹏 陈国柱李华东 ppt制作：林子鹏 李华东 引言 • 定义 • 环状 RNA (circular RNA ，circRNA) 是区别于传统线性RNA的一类新型RNA ，具有闭合环 状结构，广泛且多样地存在于真核细胞中，具有调控基因表达作用的内源性 RNA 分子。 • 早期研究历史 • circRNA 最早于20世纪70年代在RNA病毒中被发现。 • 1979 年，Hsu和Coca-Prados利用电子显微镜第一次观察到RNA可以以环状的形 式存在于真核细胞的细胞质中。紧接着，Arnberg 等在酵母的线粒体中又发现了 circRNA。 • 到了1993 年，人们在人体细胞的转录本中也发现了一些由外显子构成的circRNA。 • 但是，在当时，circRNA仅仅被认为是一类由外显子转录本发生错误剪接而形成的 低丰度RNA分子，因而对它们的研究不够深入，以至于到1999年发现的circRNA数 目也只有少数几种。 环状RNA的广泛表达 • 环状RNA不含有poly-A尾，很少在多聚腺苷酸化RNA谱研究中被发 现 • 新的测序方法： • 非多聚腺苷酸化转录组测序 • 通过RNaseR酶来富集circRNA ，RNA-seq测序，特定的算法以识别 反向剪切 • 在各个物种中识别了大量环状RNA 环状RNA的广泛表达 • 从果蝇和蠕虫到老鼠和人的后生动物中发现了超过一万种不同的 环状RNA。环状RNA也在诸如水稻和拟南芥的植物和包括真菌和 原生生物的其它生物中被发现。 • 在每个检测的细胞系中，大概50种基因的环状RNA比他们的线形 同分异构体的表达量更丰富，并且已经通过实验证实数十个环状 RNA以细胞类型特异性或组织特异性方式高度表达。 • 数千个环状RNA在大脑中积聚，数百个在人类上皮- 间质转化 （EMT）过程中上调表达。并且，circRNAs及其相应的mRNA水平 之间没有明确的相关性。 环状RNA的生物合成 • 需要剪接体参与，反向剪接 • 转录后生成 • 共转录生成 环状RNA的生物合成 • 顺式元件有助于形成环状RNA • 并不是所有的环化外显子都 被互补序列所包含。 环状RNA的生物合成 • 被RBP调控 环状RNA的功能 • miRNA “海绵” 从而间接调控基因表达 环状RNA的功能 • 调控转录 环状RNA的功能 • 环状RNA的加工影响剪接 尚未解决问题 • circRNA在细胞中的具体作用机理 • 环状RNA最终如何降解 • 在生物发生中，circRNA的差异表达仍有待充分探索 • 剪接体如何被引导进行规则剪接和反式剪接