金银花类药用植物FatB基因克隆和生物信息学分析Cloning-药学学报.PDF

1394 药学学报 Acta Pharmaceutica Sinica 20 12, 47 ( 10): 1394 1398 银花类药用植物FatB 基因克隆和生物信息学分析 1, 2 2 2 1 2* 2 2 汪周勇 , 蒋 超 , 陈 敏 , 陈 平 , 袁 媛 , 林淑芳 , 吴志刚 ( 1. 武汉工业学院, 湖北 武汉 430023; 2. 中国中医科学院中药研究所, 北京 100700) 摘要: 从忍冬 (Lonicera j ap onica Thunb.) 转录组测序结果中分析获得 1 个FatB 基因。分别以忍冬、红白 忍冬 (Lonicera j aponica Thunb . var. chinensis (Wats.) Bak.) 、红腺忍冬 (Lonicera hyp og lauca Miq.) 和水忍冬 (Lonicera dasysty la Rehd.) 新鲜花蕾为材料, 利用RT-PCR 技术克隆获得了LJFatB 、LHFatB、LJ CFatB 、LDFatB 基因的全长cDNA, 并进行生物信息学分析。结果表明LJFatB、LJ CFatB 、LHFatB 和LDFatB 与拟南芥A tFatB 具有较近的亲缘关系。LJFatB 、LJ CFatB 、LHFatB 和LDFatB 的核苷酸序列、蛋白特性及其二级结构有所差 , 但 其蛋白均具有保守的 FatB 底物结合位点和催化活性位点, 且在花蕾中的转录水平没有显著差 。因此推测 LJFatB 、LJ CFatB、LHFatB 和LDFatB 可能具有与A tFatB 相同的生物学功能。 关键词: 忍冬; FatB; 生物信息学分析 中图分类号: R93 1 文献标识码: A 文章编号: 05 13-4870 (20 12) 10- 1394-05 Cloning and bioinformatic analysis of FatB genes in Lonicera j ap onica Thunb and its substitutes 1, 2 2 2 1 2 WANG Zhou-yong , JIANG Chao , CHEN Min , CHEN Ping , YUAN Yuan , 2 2 LIN Shu-fang , WU Zhi-gang (1. Wuhan Poly technic University, Wuhan 430023, China; 2. Institute of Chinese Materia Medica, China A cademy of Chinese Medical Sciences, Beij ing 100700, China) Abstract: A FatB unigene was obtained from the transcriptome dataset of Lonicera j ap onica Th