第1章-基因组学概论.pdfVIP

生物信息学 基因组学概论 徐卓菲，博士 xuzf@ 华中农业大学动物医学院 2017年 课程安排  32学时：11周，3学时/周  开卷考试  成绩：平时成绩占70% （课后练习+课堂表 现+ 出勤率）+ 期末考试占30%  期末考试：课程论文（综合运用你所学的 生物信息学分析工具解决某个实际的生物 学问题） 什么是生物信息学？  NIH 的官方定义 Bioinformatics: Research, development, or application of computational tools and approaches for expanding the use of biological, medical, behavioral or health data, including those to acquire, store, organize, archive, analyze, or visualize such data.  生物信息学(Bioinformatics)是研究生物信息的采集、处理 、存储、传播，分析和解释等各方面的学科。它通过综合 利用生物学，计算机科学和信息技术而揭示大量而复杂的 生物数据所赋有的生物学奥秘。（来自中百度百科的定义 ） 大数据与生命科学  21世纪初，随着人类基因组学“大数据”时代的到来以及 “精准医疗”战略计划的开启，生物信息学在生物医学研 究和临床实践中的重要性日趋明显  生物信息学作为当前高新热点领域之一，与现代生物医药 发展存在密切联系，对科研成果向经济产业转化具有重大 的推动意义 大数据  数据量大  处理数据的速度快  数据类型的多样性  数据分析的复杂性 尽管生物学家花费大量精力收集数据，实际上，现在生物学面 临的瓶颈在于大数据挖掘！ ——美国乔治华盛顿大学的计算生物学研究所主任Keith Crandall 云计算和大数据 • 下一代测序技术的迅猛发展和 广泛应用产生了大量的测序数 据，在质量、数量、类型三个 方面的数据增长改变了基因组 学研究的面貌，其影响力几乎 扩展到了整个生命科学和医学 领域 • 一直以来计算机存储和处 理数据能力的增长速度都 快于生物数据的增长速度， 但2003年后，由于测序技 术的发展使得测序成本大 幅度下降，产生了大量的 生物数据，计算机的存储 和计算能力逐渐无法满足 大数据的需求 国内外有哪些生物信息云计算平台？  Galaxy