u2依赖型mrna剪接复合体相关基因多态与原发性肝癌发生风险的关联研究流行病与卫生统计学专业论文.docxVIP

学校代码：10023 学校代码：10023 学号：$2012005069 硕士学位论文 U2依赖型mRNA剪接复合体相关基因多态与原发性肝癌发 生风险的关联研究 所院： 基础学院 姓名： 宋伟 指导教师： 廖苏苏教授 导师小组： 王丽教授 学科专业： 流行病与卫生统计学 研究方向： 分子流行病学 完成日期： 2015年5月15日 万方数据 中国医学科学院北京协和医学院硕士研究生学位诊奇111111 中国医学科学院北京协和医学院硕士研究生学位诊奇 111111 11111 III III Itl IlU IIII IIl 目录 Y281 8204 摘要 I Abstract ．．． ．． ．．． ． ． ． ．． ．．．．． ．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．III 前言 ．．1 一、肝癌流行病学 1 二、肝癌危险因素 1 材料与方法 6 一、主要实验仪器 6 二、主要实验试剂和耗材 6 三、研究设计及研究对象 6 四、基因组DNA的提取 7 五、候选sNP挑选 8 六、基因分型 ．12 七、统计分析 ．16 结果 19 一、研究对象人口学特征 19 二、筛查阶段剪接复合体关键基因多态与肝癌关联性分析 23 三、验证阶段验证剪接复合体关键基因多态与肝癌的关联性 30 四、合并阶段剪接复合体关键基因多态与肝癌的关联性 31 五、单体型与肝癌发病风险的关联分析 34 六、基因一环境、环境．环境交互作用分析 一36 讨论 z12 一、遗传因素 ．42 二、环境因素 ．43 三、交互作用 ．44 四、本研究的优势与不足 44 ，J、结 46 结论 46 参考文献 ．47 附勇乏 51 附录一论文缩写词汇中英文对照表 ．．51 附录二个人简历 53 致谢 ．54 万方数据 中国医学科学院北京协和医学院硕士研究生学位论文u2依赖型mRNA剪接复合体相关基因多态与原发性肝癌发生 中国医学科学院北京协和医学院硕士研究生学位论文 u2依赖型mRNA剪接复合体相关基因多态与原发性肝癌发生 风险的关联研究 摘要 背景：原发性肝癌(Primary liver cancer，PLC，以下简称肝癌)病死率高，目前居于 全球癌症死因第三位，肝癌在我国发病人数占全球发病人数的半数以上。肝癌发病 隐匿，一旦发现往往预后很差。因此，探讨其危险因素并进行有针对性的预防是减 少肝癌人群健康危害的关键。在癌症发生的遗传和环境因素研究中，目前mRNA剪 接复合体相关基因突变与肿瘤的关系备受关注。mRNA选择性剪接影响着人类90％ 以上的基因表达，这个途径一旦发生异常，则可能影响包括细胞增殖、发育与分化 等环节的多个基因的正常剪接过程，导致肿瘤发生。201 1年以来，Nature、Cell等 杂志先后报道剪接复合体基因突变，尤其是U2核糖核蛋白体依赖型剪接复合体相 关基因(包括U2AF35、U2AF65、SFl、SRSFl、SF3A1、SF381和PRPF40B等) 突变与血液肿瘤如慢性髓细胞性白血病以及实体瘤如胰腺癌、乳腺癌以及黑色素瘤 等发生有关，我们课题组的前期研究也发现U2AF65的基因多态与胰腺癌的发生有 关，但上述基因与肝癌发生风险关联尚未见报道。 目的： 1、探讨U2依赖型mRNA剪接复合体的关键基因U2AF35、U2AF65、SRSFl、SRSF2、 SF381、SF3A1、SFl和PRPF40B与肝癌发生风险的关系。 2、分析上述基因与已报告的肝癌主要环境危险因素的交互作用对肝癌发生风险的 影响。 方法：采用以医院为基础的两阶段病例．对照研究方法： 1、筛查阶段：选择2009年5月至2012年6月武汉同济医院首次确诊的378例原 发性肝癌病例和461例同期成人体检非肿瘤对照。采用Openarray中通量分型技术 在筛查样本中对U2依赖型mRNA剪接复合体的关键基因U2AF35、U2AF65、 SRSFl、SRSF2、SF381、SF3A1、SFl和PRPF40的17个潜在功能标签单核苷酸 多态性(Single nucleotide polymorphism，SNP)位点进行基因分型；基于不同遗传模型 分析上述候选SNPs与肝癌的关联性，并探讨其与吸烟、饮酒以及HBV慢性感染的 交互作用。 2、验证阶段：选择2007年9月至2009年9月北京佑安医院首次确诊的428例原 发性肝癌病例和647例同期体检的非肿瘤对照，对筛查阶段得到的阳性位点采用 TaqMan实时荧光定量基因分型技术进行基因分型；同时探讨基因与肝癌的关联， 以及基因与环境交互作用的影响。 结果： 万方数据 中国医学科学院北京协和医学院硕士研究生学位论文1、筛查样本中观察到SF3A1基因的四个TagSNPs位点rs2074733、rs5994