E2F1调控细胞周期时程补偿机制定量研究.PDF

·870 · doi 10.3969/j.issn. 1673-4254.2013.06.17 J South Med Univ, 2013, 33(6): 870-873 基础研究 EE22FF11 调调控细胞周期时程补偿机制的定量研究控细胞周期时程补偿机制的定量研究 刘文音，朱 浩 南方医科大学基础医学院生物信息学教研室，广东 广州 510515 摘要：目的构建果蝇细胞周期调控的数学模型。方法使用一组常微分方程描述细胞周期网络中核心分子的相互作用，计算分 子浓度的连续周期性变化，并捕获分子交互的离散事件。结果计算结果吻合实验观测到的分子浓度的周期变化，揭示和解释了 细胞周期时程补偿的数学机制与定量特性。结论E2F 1（E2F transcription factor 1）所联结的正负反馈是调控G /S 与G /M 时程 1 2 补偿的核心机制。 关键词：数学模型；细胞分裂；细胞周期；E2F 1 A quantitative investigation of E2F1-regulated cell cycle compensation mechanism LIU Wenyin, ZHU Hao Department of Bioinformatics, School of Basic Medical Sciences, Southern Medical University, Guangzhou 510515, China Abstract: Objective To explore the core mechanism of cell cycle compensation using a mathematical model. Methods A set of ordinary differential equations were used to describe the interactions between the core cell cycle molecules. Continuous and cyclic changes of the concentrations of these molecules were computed to capture the discrete events of molecular interactions. Results The calculated molecule concentrations and captured signaling events agreed with the experimental results. Conclusion E2F transcription factor 1 is the pivotal element linking the positive and negative feedbacks and regulating G1/S and G2/M phase compensation. Key words: mathematical model; cell division; cell cycle; feedback; E2F1 细胞分裂持续发生在胚胎发育与肿瘤生长过程中， 散事件，通过两者进一步分析细胞周期时程补偿的内在 一次分裂经历G 、S、G 、M 四个时期以及相应的基因表 机制和数学特性。本文在实验发现E2F 1 （E2F 1 2 达调控过程。近几十年来细胞分裂受到大量实验研究， transcription factor 1）可能是调控G /S 与G /M 时程补 1 2 同时，由于细胞分裂活动精确的周期性，它们也受到许 偿的核心分子的基础上［6］，揭示了E2F 1在联结多个正负 多计算研究。由于定量描述完整的细胞周期调控十分 反馈及调控G /S 与G /M 时程补偿中的重要作用。