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植物病毒基因组的翻译
第六章 植物病毒基因组的翻译
原雪峰
内容
转录和翻译水平的表达策略概述
RNA病毒基因组结构与表达策略举例
转录水平亚基因组策略
翻译水平不依赖帽子的翻译策略
翻译水平翻译后的重编码机制
(渗漏扫描、通读、移码)
病毒基因组的多层次表达调控
(/all_by_species/915.html)
RNA病毒的表达策略
RNA病毒基因组及编码特性:
基因组小,需编码复制酶、运动蛋白及外壳蛋白
编码方式呈现多顺反子特性以及基因重叠现象
RNA水平(转录策略)
多分体基因组
亚基因组
双义RNA策略
蛋白水平(翻译策略)
RNA病毒的表达策略翻译策略
起始阶段
•内部起始(IRES/3’CITE)
•核糖体转轨
•渗漏扫描
•非 AUG起始
•重起始
延伸与终止阶段
•移码
•通读
•终止-重起
RNA病毒基因组结构与表达策略举例 (1)
亚基因组 、通读、渗漏扫描
RNA病毒基因组结构与表达策略举例 (2 )
A.A.
多体基因组
多蛋白体表达
B. 内部起始
多蛋白体表达
C.
RNA病毒基因组结构与表达策略举例 (3 )
亚基因组、渗漏扫描、多蛋白体表达
RNA病毒基因组结构与表达策略举例 (4 )
多蛋白体
亚基因组、
通读、渗漏
亚基因组
Beet necrotic yellow vein virus
亚基因组策略
(subgenomic RNA,sgRNA )
亚基因组(subgenomic RNA,sgRNA )策略
亚基因组:相对于病毒基因组而言。病毒在寄主体内的复制过程中,产生的5’ 端截
短的、具有与基因组相同3’ 末端的RNA片段,作为表达位于基因组内部和3’ 端的
ORF的mRNA存在。一般情况下,不被外壳蛋白所包装。
5’ 3’
gRNA
5’ 3’
sgRNA
更新的特性:
1. 最近发现了另一类亚基因组: 具有与基因组相同的5’末端,而是在3’ 端出现截短的
现象 (Tatineni et al., 2009, Virology)。
2. 有的亚基因组不编码任何蛋白,是作为病毒对抗宿主的抗病毒体系的因子存在。赋
予亚基因组新的功能 (Schuessler et al., 2012, JVI )。
3. 有些亚基因组反式调控其他病毒蛋白的翻译。(Shen et al., 2006 JVI )
。。。
亚基因组的发现
3’ co-terminal sgRNA
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