基于Z曲线理论的冠状病毒进化关系分析-生物物理学专业论文.docxVIP

中文摘要中文摘要 中文摘要 中文摘要 随着人类基因组、模式生物基因组计划的蓬勃发展，越来越多的生物全基因 组已完成了测序。有理由相信数据的海量积累预示着理论的重大突破，然而数据 并不等于知识，如何从冗长的数据中提取有用信息成了当前的一个热门课题。z 曲线是直观研究基因组序列的有力工具。基于z曲线理论，基因组序列可以由 一条等价的三维空间曲线唯一代表，从而使得人们对该基因组的整体和局部特征 可以一目了然。z曲线理论是本论文的理论基础，在文中的第三章里面对z曲线 理论作了简要地介绍。Z曲线理论有着广泛的应用，本文主要提出了～种以z曲 线变量为基础的进化分析新方法，并且应用此方法对各种冠状病毒之间的亲缘关 系进行了一系列的分析研究。 论文的第一部分为绪论部分，主要介绍了生物信息学发展的背景和主要研究 内容，以及一些在本论文中将要用到的生物学知识。 论文的第二部分对表形进化和分子进化研究进行了～些简单的介绍。同时介 绍了分子进化中的一些重要理论、概念，以及研究中所使用的部分软件、建树方 法以及单基因分子进化研究中所遇到的一些闯题。 论文的第三部分为本论文的核心内容，主要致力于提出以z曲线变量为基 础的进化分析新方法，并且使用该方法对冠状病毒尤其是不同时期不同病原体的 SARS冠状病毒和类SARS冠状病毒进行了一系列的进化分析。全基因组序列数 据的积累，使得不同生物之间的进化关系可以从分子水