无柄灵芝遗传多样性的SRAPITSTEFα和LSU分析-微生物学报.PDF

微生物学通报 Dec. 20, 2016, 43(12): 2667−2677 Microbiology China /wswxtbcn tongbao@ DOI: 10.13344/j.microbiol.china.150936 研究报告 无柄灵芝遗传多样性的SRAP、ITS 、TEF1-α和LSU 分析 1,2 2 1 1 1 1 1* 谭秀梅 阿地力·沙塔尔 朴春根 薛寒 郭民伟 汪来发 李永 (1. 100091) (2. 830052) 摘 要：【目的】研究来自我国不同地区的45 株无柄灵芝菌株的遗传多样性。【方法】利用ITS 、 TEF1-α和LSU 多基因分析及SRAP 分子标记两种方法，对供试无柄灵芝菌株进行聚类分析和 遗传多样性研究。【结果】筛选出8 对 SRAP 引物共扩增出95 条条带，其中具有多态性条带 79 条，平均多态性比例为82.4%，多态性信息含量(PIC)变幅在0.28−0.43 ，平均为0.38。ITS 、 TEF1-α和LSU 多基因序列分析结果显示，同一地域的部分菌株聚在一起，亲缘关系较近，而 地域相隔较远的部分菌株也聚在同一个进化支上，其亲缘关系也很近，这与SRAP 聚类分析结 果相吻合。【结论】无柄灵芝菌株遗传多样性较为丰富，其遗传相似性与地理分布存在一定的 相关性，ITS 、TEF1-α、LSU 基因及多基因分析更适合无柄灵芝分类鉴定，而 SRAP 分子标记 更适合于无柄灵芝遗传多样性分析。 关键词：无柄灵芝，SRAP，ITS ，TEF1-α，LSU ，遗传多样性 Genetic diversity of Ganoderma resinaceum by SRAP, ITS, TEF1-α and LSU markers TAN Xiu-Mei1,2 ADIL·Sattar2 PIAO Chun-Gen1 XUE Han1 GUO Min-Wei1 WANG Lai-Fa1 LI Yong1* (1. Research Institute of Forest Ecology, Environment and Protection, Chinese Academy of Forestry, Beijing 100091, China) (2. College of Forestry and Horticulture, Xinjiang Agricultural University, Urumqi, Xinjiang 830052, China) Abstract: [Objective] Genetic diversity and relationship of 45 Ganoderma resinaceum strains from different areas in China were analyzed. [Methods] We studied clustering analysis and genetic diversity of these isolates using multi-gene analysis with ITS, TEF1-α, LSU sequences and SRAP technique. [Results] 8 pairs of primers on 45 strains were selected and amplificated using