合成生物学工业应用的现状和展望-中国科学院院刊.PDF

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应用领域 Application 合成生物学工业应用的现状和展望 曾 艳 赵心刚 周 桔* 中国科学院科技促进发展局 北京 100864 摘要 通过合成生物学技术可以实现化学品的生物合成,从而为摆脱石油资源依赖提供了可能。合成生物学技术的 发展极大地提高了微生物细胞工厂生产化学品的能力,创造的新菌种、新工艺可以有效替代传统工艺,显著降低 污染,大幅减少能耗,提升传统发酵行业的技术水平。文章对利用合成生物学技术构建细胞工厂以及构建多酶分 子机器来生产化学品的关键因素和典型案例进行了综述,并对合成生物学技术工业应用的未来进行了展望。 关键词 合成生物学,化学品,细胞工厂,多酶分子机器 DOI 10.16418/j.issn.1000-3045.2018.11.009 化工炼制是工业社会必需物质资源的传统获取途 1 合成生物学技术构建微生物细胞工厂的技 径。但化工炼制以不可再生的石油资源为基础,很多 [1] 术路线 生产过程存在高能耗、高污染的问题 。以绿色清洁的 方式实现化学品的生产,对于实现国民经济的可持续 转化率、生产速率和产量是决定微生物细胞工厂 发展至关重要。通过合成生物学技术,可以改造自然 是否能实现工业应用的 3 个关键指标。通过最优合成途 界中微生物的合成能力,甚至创造新的合成途径。通 径的设计、合成途径的优化和细胞生理性能优化,可以 过构建高效的细胞工厂,利用可再生的生物质资源为 显著提升微生物细胞工厂生产化学品的转化率、生产速 原料生产各种化学品,发展生物制造产业,将有力促 率,最终实现产量增加。 进国家经济发展方式的转变,确保节能减排的目标实 1.1 提高转化率:最优合成途径的设计路径 现。 化学品生物制造的成本中,原料成本所占比重最大 本文对利用合成生物学技术构建细胞工厂,以及构 (通常超过50% ),因此提升微生物细胞工厂的转化率 建多酶分子机器来生产化学品的关键因素和典型案例进 是实现工业化应用最为关键的因素。转化率越高,生产 行了综述,并对合成生物学技术工业应用的未来进行了 化学品所需要消耗的原料越少,成本也就越低。在设计 展望。 最优合成途径时,底物的碳代谢流和还原力的供给是两 * 通讯作者 修改稿收到时间:2018年10月31 日 院刊 1211 应用领域 个关键因素。自然界中微生物的代谢网络非常复杂,为 表达,从而维持代谢途径的动态平衡,达到提高产品合 了获得最大的转化率,要改变底物的碳代谢流,使其最 成能力的目标[5] 。 大限度地集中于目标化学品的合成。因此,细胞工厂的 (3)蛋白骨架技术。在细胞体内的代谢途径中,参 构建首先需要创建微生物的基因组代谢网络和调控网络 与反应的酶的空间位置是影响代谢途径效率的一个重要 模型,然后在此基础上设计出目标化学品的最优合成途 因素。通过人工合成的蛋白骨架,使酶以特定位置和序 径,避免其他副产物的竞争,使目标化学品的合成途径 列附着在骨架上,可以控制代谢途径中酶的空间位置, 在热力学上可行,合成过程能量供给充足[2] 。除了碳代谢 从而使合成途径相邻的酶聚集在物理空间比较近的区 流分布之外,还原力的供给也至关重要。底物代谢产生 域,使底物和酶距离接近,提高生化反应的速率[6] 。另 的还原力要满足化学品合成所需的还原力。 外,蛋白骨架也可以

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