基于机器学习的药物研发方法研究-模式识别与智能系统专业论文.docxVIP

独创性声明本人声嬲所呈交的学位论文是本人在导l师指导下进行的研究工作及取得的 独创性声明 本人声嬲所呈交的学位论文是本人在导l师指导下进行的研究工作及取得的 研究成果。据我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其 能人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得安徽大学或其他教育机构的 学位或证书丽使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所儆的任何贡献均己 在论文中作了明确的说明并表示谢意。 学位论文作者签名：学位论文作者签名：。孑＼气／≮易＼、气；之 签字日期：签字日期： 枷7岁年夕月≯j日枷7岁年夕月≯7日 学位论文版权使用授权书 本学位论文作者完全了解安徽大学有关保留、使用学位论文的规定。有权 保留并向舀家有关部门或机构送交论文的复印俘和磁盘，允许论文被查阅和借 孥位=文慧鞠槭：恸伊学位论文作者签名： 氏夏欠 导癖签名：夕二形J D 签字日期：wf多年罗月y1日 签字日期： ≯f厂年厂月叫日 万方数据 摘要摘要 摘要 摘要 近些年，由于人类的肆意破坏，地球环境质量越来越差，对人体造成的伤害 也越来越严重，大量新的疾病以及传统的疾病无法根除，许多新的药物亟待研制， 对药物研发工作者的压力十分巨大，传统的药物开发过程十分漫长和复杂，大量 的候选药物在临床试验阶段被淘汰。因为化合物作为药物，在生物体中发挥作用 需要面对大量的考验，许多具有针对性的药物在实验中表现出很高的活跃性，但 是当它真正作用于生物体时，由于生物体本身的复杂性以及化合物在体内作用时 的不确定性，出现许多不理想的结果，甚至严重的副作用。所以提高候选药物的 质量显得尤为重要。而药物的研发阶段中，对受体的准确匹配是一个重要的要求， 这样可以提高候选药物研发的有效性：同时，由于生物体作用机制复杂的原因， 确定药物是否满足药代动力学模型也是非常关键的一环，这会帮助候选药物在临 床试验中降低淘汰率。 本文主要是从目前运用广泛的机器学习的角度出发，结合药物的基本属性， 建立预测模型来提高候选药物的成功率。文章的第一部分围绕着药物与靶标之间 存在的关系，建立相互作用网络，利用已知相互作用数据，基于网络推理的方法， 来预测未知药物与靶标之间是否相互作用。第二部分的研究工作主要集中在人体 细胞色素P450酶的抑制性研究，因为P450这种人体细胞色素酶在生物体主导了 绝大多数已经被使用的药物的氧化代谢反应，药物对这种细胞色素酶表现出抑制 性与否，直接这种药物的实际使用价值相关。所以，在药物研发过程中，候选药 物对于这种酶的抑制性十分重要。本文的第三部分，从化合物的基本属性一水溶 性角度出发，建立机器学习模型来预测化合物的水溶性。因为目前许多上市药物 是属于口服药物，其在生物体中的吸收代谢，与其自身的水溶性息息相关。 关键词：药物研发，药物靶标相互作用，细胞色素P450酶，极限学习机， 化合物水溶性，机器学习 万方数据 ABSTR ABSTR ACT Abstract In recent years，reckless behaviors of human beings destroy the environment， which，in turn，causes increasing harm to human bodies．Since a lot of new diseases as well as traditional diseases cannot be eradicated，many new drugs are badly needed to be developed．This is a great pressure to workers who are engaged in drug research and development．Development process of traditional drug is very long and complex， and a lot of candidate drugs are eliminated at the stage of clinical trials．Chemical compounds，used as drugs，face a lot of challenges while producing effect on organisms．Many specific drugs show high activity in the experiment，but when they take effect on the organisms directly,unexpected results，even the serious side effects will happen due to the com