课件：出具肿瘤靶向治疗研究报告.pptx

出具肿瘤靶向治疗研究报告，用OKR很OK！The world leader in serving science出具肿瘤靶向治疗研究报告，用OKR很OK！OKR 诞Th前景OKR 秘制性能OKR 报告概览For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.出具肿瘤靶向治疗研究报告，用OKR很OK！OKR 诞Th前景OKR 秘制性能OKR 报告概览For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.肿瘤研究中的分子标记今日挑战越来越多的肿瘤生物标志物需要进行验证，发掘其潜在的临床应用价值全球信息多，但是数据信息杂乱且不规范通过新一代测序（NGS）的变种需要快速筛选出准确的相关信息目前的方法很费时费力，需要从多个来源进行广泛的研究， 以便将相关信息映射到变体。For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.Ion Torrent Oncomine研究分析流程测序数据分析Ion Reporter? Software and Ion Torrent? Oncomine? Knowledgebase Reporter定义突变挖掘变异，创建自定义报告肿瘤样本文库制备NGS测序Formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE)Ion AmpliSeq? technologyIon GeneStudio? S5 and Ion PGM? Systems从FFPE样本中提取DNA和RNA包括小样品，如细针抽吸简单快速的文库制备低至10 ng的输入量简单灵活的测序方案使测序变得更加简单准确For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.Ion Torrent Oncomine数据分析流程序列分析注释和过滤Th成自定义报告Torrent Suite? SoftwareIon Reporter Software with Oncomine? plug-inOncomine Knowledgebase ReporterStreamlines sequencing runs and creates BAM filesCalls variants; identifies and annotates cancer driversLinks variants to relevant, published evidence开始目标测序分析识别可能的驱动变异快速生成自定义报告For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.自动化的数据分析服务器 —— Ion Reporter? 服务器友好可视化界面助力数据注释内置主流的生物信息分析软件,可通过界面分析数据或后台linux界面分析数据自动化分析ampliseq靶向测序数据，对变异信息进行常见数据库注释(GO,MAF,OMIM等)进行cnv及fusion分析支持客户自定义数据库For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.自动化的数据分析服务器 —— Ion Reporter? 服务器Ion Reporter内置丰富的Th物学知识库帮助注释和过滤数据Annotation5000 exomesGene panelPhylopPAllele coverageGene setPolyPhen-2Allele frequencyGenetic categoryReferenceAmino acid changeGenotypeReference / variant coverageGenetic categoryGene OntologySIFTClinVarGrantham scoreSizeCodingHotspot informationTranscript setCopy numberIngenuityTypeCOSMICLocationVariant effectCoverageLocusVariant KBCustomMAFCytogenetic bandMother genotypedbSNPNamed VariantsDrugBankOMIMFather genotypep-valueGene modelsPfamFor Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.Oncomine