反枝苋乙酰乳酸合成酶与烟嘧磺隆分子结合模式分析及抗性位.PDFVIP

农药学学报 2019, 21(1): 26-34 Chinese Journal of Pesticide Science • 研究论文 • DOI: 10.16801/j.issn.1008-7303.2019.0004 反枝苋乙酰乳酸合成酶与烟嘧磺隆分子 结合模式分析及抗性位点预测 杨冬臣, 霍静倩, 张 哲, 齐 萌, 张金林* (河北农业大学 植物保护学院，河北 保定 071000) 摘 要：为研究反枝苋对乙酰乳酸合成酶 (ALS) 抑制剂的抗性机制，本研究根据反枝苋的 ALS 氨基酸序列，利用同源模建的方法构建了其三维结构，并采用分子对接和分子动力学模拟 的方法预测了反枝苋AL S 与烟嘧磺隆分子的结合模式。根据结合模式对已报道的Pro 197 和 Trp 574 等位点突变产生抗性的原因进行了分析。结果发现：Pro 197 和Trp 574 等位点的残基 与烟嘧磺隆分子之间存在重要的疏水作用和π-π 作用等其他相互作用，或该位点的残基具有特 殊结构影响着通道形状。分析表明，ALS 与烟嘧磺隆之间的氢键、疏水作用等非共价相互作用 以及通道形状的改变都有可能影响二者结合稳定性，从而使杂草产生抗性。基于此结论，本研 究预测Val 196 、Met 200 、Phe 206 和Lys 256 突变同样可能使杂草对ALS 抑制剂敏感度发生 变化。本研究利用计算机模拟技术分析了AL S 抗性机制，为反抗性除草剂的分子设计提供了 指导。 关键词: 反枝苋；乙酰乳酸合成酶；烟嘧磺隆；靶标抗性；同源模建；分子动力学 中图分类号：O629.8;S481.4 文献标志码：A 文章编号：1008-7303(2019)01-0026-09 Binding modes of acetolactate synthase with nicosulfuron in Amaranthus retroflexus L. and potential resistance sites prediction YANG Dongchen, HUO Jingqian, ZHANG Zhe, QI Meng, ZHANG Jinlin* (College of Plant Protection, Agricultural University of Hebei , Baoding 071000, Hebei Province, China) Abstract: In order to study the resistance mechanism of Amaranthus retroflexus L. to acetolactate synthase (ALS) inhibitor, homologous modeling was conducted to construct the three-dimensional structure of ALS based on its amino acid sequence of Amaranthus retroflexus L.. Molecular docking and molecular dynamics simulations were used to predict the binding mode between the ALS