油棕等热带植物DXS基因的生物信息学分析-广西植物.PDF

ｈｔｔｐ:/ / ｊｏｕｒｎａｌ.ｇｘｚｗ.ｇｘｉｂ.ｃｎ － 　 Ｇｕｉｈａｉａ　 Ａｐｒ. ２０１６ꎬ３６(４):４７１ ４７８ － ｈｔｔｐ:/ / ｗｗｗ.ｇｕｉｈａｉａ ｊｏｕｒｎａｌ.ｃｏｍ ＤＯＩ:１０.１１９３１/ ｇｕｉｈａｉａ.ｇｘｚｗ２０１４０６０１３ － 石鹏ꎬ曹红星ꎬ李东霞ꎬ等. 油棕等热带植物ＤＸＳ基因的生物信息学分析 [Ｊ]. 广西植物ꎬ２０１６ꎬ３６(４):４７１ ４７８ ＳＨＩＰꎬＣＡＯＨＸꎬＬＩＤＸꎬｅｔ ａｌ.ＢｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓａｎａｌｙｓｉｓｏｆＤＸＳ ｇｅｎｅｆｒｏｍｓｉｘｔｒｏｐｉｃａｌｐｌａｎｔｓｉｎｃｌｕｄｉｎｇｏｉｌｐａｌｍ (ＥｌａｅｉｓｇｕｉｎｅｅｎｓｉｓＪａｃｑ.)[Ｊ].Ｇｕｉｈａｉａꎬ２０１６ꎬ － ３６(４):４７１ ４７８ 油棕等热带植物ＤＸＳ基因的生物信息学分析 石　 鹏ꎬ曹红星ꎬ李东霞ꎬ王　 永ꎬ雷新涛∗ ( 中国热带农业科学院椰子研究所 海南省热带油料作物生物学重点实验室ꎬ海南 文昌５７１３３９ ) 摘　 要:油棕等热带植物含有丰富的胡萝 卜素和维生素Ｅ等类异戊二烯物质ꎬ类胡萝 卜素和甾醇等类异戊二 烯物质在植物生命活动中扮演重要角色ꎬ并且对保护人类健康具有重要意义ꎬＭＥＰ 途径是合成类异戊二烯的 重要途径之一ꎮ ＤＸＳ是ＭＥＰ途径中的第一个限速酶ꎬ其功能在油棕等热带植物中极其保守ꎮ 为了弄清油棕 等热带植物ＤＸＳ的结构和功能特点ꎬ该研究利用生物信息学工具和软件对以油棕等热带植物类异戊二烯合 成关键基因ＤＸＳ为对象ꎬ进行核酸和氨基酸序列的理化性质、蛋白质结构以及功能结构域等分析ꎬ探讨了不 同物种间的亲缘关系ꎮ 结果表明:ＤＸＳ基因起始密码子均为ＡＴＧꎬ终止密码子则分为ＴＡＧ、ＴＡＡ 和ＴＧＡꎬＤＸＳ 蛋白质属于不具有信号肽的亲水性蛋白ꎬ可能作为转运蛋白在叶绿体基质中发挥作用ꎬ未发现明显的跨膜结 构域ꎬ磷酸化位点有３６个ꎬ其中丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸位点分别为１７、１１和８个ꎬ无规则卷曲和α￣螺旋是蛋 白质二级结构主要的结构元件ꎬ三级结构预测具有 ＤＸＳ酶特征ꎬ硫胺素焦磷酸盐结合位点和ＰＬＮ０２５８２保守 结构域ꎬ不同植物ＤＸＳ功能结构域非常保守ꎬ可以作为判断不同物种间亲缘关系的重要依据ꎮ 该研究结果为 油棕等热带植物ＤＸＳ的结构、功能分析和利用提供了进一步的信息ꎬ为其品质性状分子机制研究及遗传改良 奠定了基础ꎮ 关键词:油棕ꎬＤＸＳ基因ꎬ生物信息学ꎬ系统进化树 中图分类号:Ｑ８１１.４　 　 文献标识码:Ａ　 　 文章编号:１０００￣３１４２(２０１６)０４￣０４７１￣０８ Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆＤＸＳ ｇｅｎｅ ｆｒｏｍ ｓｉｘ ｔｒｏｐｉｃａｌ ｐｌａｎｔｓ ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ ｏｉｌ ｐａｌｍ (Ｅｌａｅｉｓ ｇｕｉｎｅｅｎｓｉｓ Ｊａｃｑ.) ＳＨＩ ＰｅｎｇꎬＣＡＯ Ｈｏｎｇ￣ＸｉｎｇꎬＬＩ Ｄｏｎｇ￣ＸｉａꎬＷＡＮＧＹｏｎｇꎬＬＥＩ Ｘｉｎ￣Ｔａｏ∗ (ＨａｉｎａｎＫｅｙ ＢｉｏｌｏｇｉｃａｌＬａｂｏｒａｔｏｒｙ ｏｆ Ｔｒｏｐｉｃａｌ Ｏｉｌ ＣｒｏｐｓꎬＣｏｃｏｎｕｔＲｅｓｅａｒｃｈＩｎｓｔｉｔｕｔｅꎬ ＣｈｉｎｅｓｅＡｃａｄｅｍｙ ｏｆ ＴｒｏｐｉｃａｌＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ ＳｃｉｅｎｃｅｓꎬＷｅｎｃｈａｎｇ ５７１３３９ꎬＣｈｉｎａ ) Ａｂｓｔｒａｃｔ:Ｔｈｅ ｐａｐｅｒｕｎｒａｖｅｌｅｄｓｔｒｕｃｔ