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总RNA提纯试剂盒
操作步骤
准备
估算Redzol或组织细胞的用量。每1ml Redzol的组织用量为50~100mg;细胞用量为5~10×106个细胞
组织或细胞的裂解
贴壁细胞
吸尽培养液,加入Redzol,用移液器反复吹打数次,确保全部裂解,然后转移至新的离心管中。裂解10cm2细胞需要1ml Redzol。
注:Redzol的加入量不是根据细胞数目来决定,而是根据细胞培养皿的面积(10cm2/ml)来决定。
悬浮细胞
离心收集细胞,吸尽液体,加入Redzol用移液器吹打数次,确保全部裂解(某些酵母和细菌要用匀浆器匀浆才能全部裂解),然后转移至新的离心管中。按1ml Redzol可裂解5~10×106动物、植物、酵母细胞或1×107细菌细胞的比例加入Redzol裂解细胞。
注:应避免在Redzol加入前洗涤细胞,这样会增加mRNA降解的几率。
组织
先将新鲜组织剪成小块,放入匀浆器内,加入Redzol用匀浆器匀浆,然后转移至新的离心管中。或者将组织在液氮中研磨成粉末后,加入Redzol中。每50~100mg的组织加入1ml Redzol进行裂解。
注:样品总体积不要超过所用Redzol体积的10%。
分相
a. 将匀浆液15~30℃
b. 每1ml Redzol中加入0.2ml的三氯甲烷(氯仿),震荡混匀后15~30℃静置2~
c. 12,000rpm离心15分钟。离心后混合物分成三相(下面的酚/氯仿相、中间的白色界面、上面的无色水相)。RNA全部在无色的水相中。
注:对于含有高浓度蛋白、脂肪、多糖或纤维素(肌肉、脂肪组织、植物的微管组织)的样品,在分相前可以附加一个分离步骤,匀浆后12,000rpm离心10分钟弃沉淀。RNA溶解在上清液中,纤维素、多糖、大分子量的DNA以不溶的形式沉淀从而与RNA分离。对于脂肪组织的样品,上面一层脂肪组织可以被清除掉,将清澈的匀浆液转移到另一新管中,继续进行第3步分相。
柱纯化
转移上层水相到另一新的1.5ml离心管中,加入200μl无水乙醇,颠倒混匀。
将混合液吸入离心纯化柱(硅胶膜)中,静置3分钟,12,000rpm离心2~3分钟。
倒掉收集管中的废液,将离心纯化柱重又套入收集管中。加入600μl RNA洗涤液,12,000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液。
12,000rpm再离心2分钟,尽量除尽液体。将离心纯化柱套入干净的1.5ml离心管中,加入50μl DEPC处理的超纯水或0.5% SDS于离心纯化柱正中(不要粘在管壁上),静置1~2分钟,12,000rpm离心1分钟。
将洗脱液吸入离心纯化柱中再洗脱一次,以提高RNA的回收量。洗脱下来的液体即是纯化的RNA,-20℃
常见问题解答
每mg组织或106培养细胞的RNA产率
肝和脾 6~10μg 肾 3~4μg
骨骼肌和脑 1~1.5μg 胎盘 1~4μg
上皮细胞 5~8μg 纤维原细胞 5~7μg
RNA产率低
样品裂解或匀浆不完全;提取的RNA溶解不完全。
A260/A2801.65
紫外检测时RNA样品应用水稀释,不能用TE稀释,低盐离子溶液和低pH值溶液致使其在280nm的吸收值增加(Wilfinger, W. et. al, Biotechniques 22: 474-481; Fox, D.K.(1998) Focus 20: 2 p.37);样品匀浆时加入Redzol试剂体积太少,匀浆后溶液分层不明显,水相被酚污染;最后提取的RNA样品不能完全溶解。
RNA降解
使用的动物组织没有被立即冻上或放入Redzol中匀浆;分离使用的样品或制备的RNA长期贮存在-5~-20℃,而不是贮存在-60℃~
DNA污染
样品匀浆时加入试剂体积太少;分离使用的样品含有有机溶剂(乙醇,DMSO等),盐离子或碱溶液。
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