中国科技大学课件系列：《生物信息学》03序列比对教学精品.pptVIP

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2019-03-30 发布于天津
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中国科技大学课件系列：《生物信息学》03序列比对教学精品.ppt

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生物信息学;本章内容提要;第一节序列比对的数学基础;排列组合;概率模型;概率分布;二项分布;二项分布的期望值与标准方差;泊松分布(Poisson distribution);泊松分布与二项分布的近似;例1：鸟枪法的覆盖率;鸟枪法：覆盖率;覆盖率 vs. 准确性;例2：泊松分布;超几何分布;超几何分布 (2);超几何分布右尾概率;超几何分布左尾概率;超几何分布双尾概率;Fishers Exact Test;Fishers Exact Test;统计显著性假设检验中的P 值 (P value);假设检验;例 3：超几何分布;例 3：超几何分布;例 3：超几何分布;例 3：超几何分布;第二节，双序列比对算法;1. 点阵法;点阵法：自身的比对;点阵法：重复序列 ;点阵法：反向重复/回文;点阵法：不同序列的比对 ;点阵法的序列比对 ;计算效率;NP问题;P/NP问题-千禧年大奖难题之一;P/NP/NPC问题;2. 动态规划算法 ;打分模型;BLOSUM62替代矩阵;空位罚分;递归和动态规划算法;递归和动??规划算法 (2);例：全局比对;动态规划算法：全局比对;全局比对 (2);全局比对 (3);全局比对 (4);全局比对 (5);全局比对 (6);全局比对 (7);全局比对 (8);回溯：比对结果;局部优化比对;局部优化比对 (2);局部优化比对 (3);局部优化比对 (4);局部优化比对 (5);局部优化比对 (6);局部比对结果：;打分有何不同？;