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江苏农业学报(JiangsuJ.of Agr.Sci. ),2015,31(4):840 ~845
840 http:/ /
李大命,张彤晴,唐晟凯,等. 太湖大银鱼(Protosalanx chinensis)细胞色素b基因序列多态性分析[J].江苏农业学报,2015,31
(4):840-845.
doi:10.3969/ j.issn.1000-4440.2015.04.021
太湖大银鱼(Protosalanx chinensis)细胞色素 b 基因
序列多态性分析
李大命, 张彤晴, 唐晟凯, 钟立强
(江苏省淡水水产研究所,江苏省内陆水域渔业资源重点实验室,江苏 南京 210017)
摘要: 为科学保护太湖大银鱼种质资源,制定合理的野生资源保护策略,实现太湖大银鱼资源的可持续发展
和利用,以细胞色素b基因(cyt b)作为分子标记,对太湖大银鱼野生群体进行遗传多样性分析。 通过PCR扩增与
序列测定获得了cytb基因全长序列(1 141bp)。 在35条同源cytb基因序列中,A、T、G和C碱基的平均含量分别
为21.67%、29.25%、16.71%和32.36%,A+T 的含量(50.92%)略高于G+C的含量(49.07%)。 Cyt b 中共检出13
个变异位点,总变异率为1.14%,其中9个为简约信息位点,4个为单一信息位点。 35条cyt b序列共定义12个单
倍型,单倍型之间的平均遗传距离为0.003,NJ法构建的单倍型系统进化树显示所有单倍型聚为一支,单倍型多样
性指数和核苷酸多样性指数分别为0.850±0.045 和0.00296±0.000 17,平均核苷酸差异数为3.378。 中性检验分
析结果显示Tajima’sD值为0.224 52,且差异不显著(P0.10),这表明太湖大银鱼种群稳定,没有经历种群扩张。
关键词: 大银鱼; 细胞色素b基因; 遗传多样性; 太湖
中图分类号: S964.1 文献标识码: A 文章编号: 1000-4440(2015)04-0840-06
Genetic polymorphism of mitochondrial DNA cytochrome b (cytb) se-
quences of Protosalanx chinensis in Lake Taihu
LI Da-ming, ZHANGTong-qing, TANG Sheng-kai, ZHONG Li-qiang
(Freshwater Fisheries Research Institute of JiangsuProvince/ Key Laboratory of Fisheries Resources in Inland Water,Nanjing 210017,China)
Abstract: ToprotectProtosalanx chinensis germplasm,andmaintainitssustainabledevelepment inLakeTaihu,the
cytochrome b (cyt b) gene marker was selected for the genetic diverisity analysis. The completed mtDNA cyt b gene se-
quence (1 141bp)ofP.chinensiswereobtainedthroughPCRamplificationandsequenceanalysis. Theaveragecontentsof
base A,T,G and C in 35 homological cyt b genes were 21.67%,29.25%,16.71% and 32.36%,respectively,with
content of A+T (50.92%)alittlehigherthanthat of G+C (49.07%). Thirteenvariation sitesweredetected,acconuting
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