基于微卫星分子标记的皖南凹耳臭蛙种群遗传结构-动物学专业论文.docxVIP

基于微卫星分子标记的皖南凹耳臭蛙种群 遗传结构 姚 龙 安徽师范大学硕士学位论文 二○一五年四月 · ·I· 本论文经答辩委员会全体委员审查，确认符合安徽师范大学 硕士学位论文质量要求。 答辩委员会签名: 主席:(工作单位、职称) 委员: 导师: 学 位 论 文 独 创 性 声 明 本 人 声 明 所 呈 交 的 学 位 论 文 是 本 人 在 导 师 指 导 下 进 行 的 研 究 工 作 及 取 得 的 研 究 成 果 ， 与 我 一 同 工 作 的 同 志 对 本 研 究 所 做 的 任 何 贡 献 均 已 在 论 文 中 作 了 明 确 的 说 明 并 表 示 谢 意 ， 除 了 文 中 特 别 加 以 标 注 和 致 谢 的 地 方 外 ， 论 文 中 不 包 含 其 他 人 已 经 发 表 或 撰 写 过 的 研 究 成 果 。 学位论文作者签名： 签字日期： 年 月 日 学位论文版权使用授权书 本 学 位 论 文 作 者 完 全 了 解 安 徽 师 范 大 学 有 关 保 留 、使 用 学 位 论 文 的 规 定 ：学 校 有 权 保 留 并 向 国 家 有 关 部 门 或 机 构 送 交 论 文 的 复 印 件 和 电 子 版 ， 允 许 论 文 被 查 阅 和 借 阅 。本 人 授 权 安 徽 师 范 大 学 可 以 将 学 位 论 文 的 全 部 或 部 分 内 容 编 入 有 关 数 据 库 进 行 检 索 ， 可 以 采 用 影 印 、 缩 印 或 扫 描 等 复 制 手 段 保 存 、 汇 编 学 位 论 文 。 保 密 的 学 位 论 文 在 解 密 后 适 用 本 授 权 书 。 学位论文作者签名： 导师签名： 签字日期： 年 月 日 签字日期： 年 月 日 学 位 论 文 作 者 获 学 位 后 去 向 ： 工 作 单 位 ： 电 话 ： 通 讯 地 址 ： 邮 编 ： · · PAGE IV· · · PAGE III· 基于微卫星分子标记的皖南凹耳臭蛙 种群遗传结构 摘 要 前期研究表明，皖南凹耳臭蛙(Odorrana tormota)呈现出以青弋江、新安江 和水阳江为纽带间断分布的特点。本研究利用多态性微卫星位点作为分子标 记，探讨以下几个科学问题：现存种群的微卫星遗传变异及其分布特点？种群 间的基因流水平和扩散模式？种群遗传格局及其形成原因？针对上述问题，本 研究利用 7 个多态性微卫星位点对皖南凹耳臭蛙 6 个种群 145 个样品的遗传变 异及其空间分布模式进行分析。获得以下主要结果： 1. 7 个微卫星位点从 145 个样品中共检测到 156 个等位基因，各位点等位 基因数 8~34 个，平均为 22.286。各种群有效等位基因数为 6.389～9.327，平均 有效等位基因 7.622，平均等位基因丰富度为 11.186，桃岭种群有效等位基因 数最高，而漳河种群最低。 2. 种群总的观测杂合度和期望杂合度分别为 0.687 和 0.804，各子种群的 观测杂合度变化范围为 0.613～0.727，香溪种群的观测杂合度最高，西坑种群 最低；期望杂合度变化范围为 0.774～0.818，程坑种群的期望杂合度最高，浮 溪种群最低。7 个微卫星位点的联合检验结果显示，6 个种群均显著地偏离哈 温平衡，均表现为杂合度缺失。所有种群的近亲系数均大于 0.05，平均近交系 数为 0.108。 综合有效等位基因数、等位基因丰富度和其为杂合度等遗传参数，与其它 无尾两栖动物相比，凹耳臭蛙种群微卫星遗传变异处于较高水平。 3. AMOVE 分析结果显示，凹耳臭蛙种群 98.19%的变异分布于种群内，只 有 1.81%存在于种群间，种群间已经产生了显著的遗传分化（Fst=0.01808， p0.001）。两两种群间的比较分析显示，新安江水系的漳河种群和水阳江水系 的程坑种群与其它种群间均发生了极显著的遗传分化（p0.01），此外，新安 江水系的浮溪种群与青弋江水系的桃岭和西坑种群之间也存在显著的遗传分 化 （p0.05 ）， 但与 同属 青 弋 江水 系的 香 溪种 群 之间 还存 在 丰富 的基 因 流 （Nm=190.59）。Mantel test 分析结果显示凹耳臭蛙种群间遗传分化与地理距离 间没有正相关性（r=0.1325，p=0.297。综合分析发现，皖南凹耳臭蛙种群的遗 传分化呈现两个特点：不同水系间直线距离相距较远的种群分化更为明显；直 线距离相距较近的种群之间通常存在较强的基因流。揭示该物种短距离扩散可 通过陆地进行，而长距离扩散主要依靠水系的连通性。 4. 比较分析种群间基于核微卫星的遗传分化系数与基于母系遗传的线粒 体 cyt b 基因的遗传分化系数，结果显示，两两种群间的核微卫星