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植物生理学报 Plant Physiology Journal 2017, 53 (7): 1267–1278 doi: 10.13592/ki.ppj.2017.0146 1267
普通油茶转录组EST-SSR分子标记开发
1 2 3 1 1 1 1,*
, , , , , ,
李海波 王珊 丁红梅 陈友吾 胡传久 李楠 魏海龙
1 , 310023; 2 , 311300; 3
浙江省林业科学研究院 杭州 浙江农林大学林业与生物技术学院 浙江临安 浙江中医药大学分析测试中
, 310053
心 杭州
: (Camellia oleifera) EST-SSR ,
摘要 通过转录组测序技术鉴别普通油茶 位点 开发筛选适用于普通油茶种质资源评价与利用
SSR , MISA
的多态性 标记 对普通油茶的遗传变异研究和油茶良种的分子标记辅助育种具有重要意义。利用 工具从普通油
67 434 Unigenes (63.39 MB) 26 751 1~6 SSR , SSR
茶转录组 条 中筛选得到 个包含 个核苷酸重复类型的 位点 的分布频率为
39.67%, 1/2.33 kb; SSR , SSR 44.28%, (35.28%)
发生频率为 位点中的主导类型是二核苷酸重复 占总 的 其次是单核苷酸 和三核
(18.27%) SSR , 143 SSR 20
苷酸重复 。通过 标记的琼脂糖凝胶电泳和荧光标记毛细管电泳 从 对 引物中遴选出了 对扩增效率
SSR , 57 : 20 SSR
高、稳定性好的多态性 引物 并对来自浙江产区的 个普通油茶品种进行遗传关系分析。结果显示 对 引物共
129 , 2~17 , 6.45 ; (PIC) 0.0499~0.8635, 0.4355 57
检测出 个等位基因 每对引物 个 平均 个 多态性信息量 为 平均 。 个普通油茶品
Dice 0.47 , 0.60
种在 遗传相似系数大约 时聚为一类 在大约 时可分为七个大类。本研究印证了利用普通油茶转录组数据开发
SSR , SSR ;
标记的可行性 也证明了茶属树种 标记的可转移性 不仅为普通油茶遗传多样性分析和遗传图谱构建提供了有价
,
值的候选标记 也为普通油茶良种的鉴别与分子选育提供了分子技术手段。
: ; ; EST-SSR; ;
关键词 油茶 转录组 遗传关系 多态性
油茶是山茶属
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