芹菜EST-SSR分析.pdfVIP

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2019-04-12 发布于浙江
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上海农业学报2013，29(2)：24—28 Acta AgriculturaeShanghai 文章编号：1000．3924(2013)02．024—05 芹菜EST-SSR分析褚云霞1’2～，黄志城1’2，李寿国2，顾可飞1’2，陈海荣1’¨，顾晓君2 (1上海市农业科学院农产品质量标准与检测技术研究所，上海201403； 2农业部植物新品种DUS测试(上海)分中心，上海201415；3上海交通大学农业与生物学院，上海200240) 摘要：以NCBI公布的EST数据为基础，通过一系列软件处理，连接成长175．294kb的无冗余EST序列 3设计出引物15对，结合 324条，从23条序列中发现25个SSR，每7．011kb出现1个SSR位点。运用Primer 文献公布的11对引物，以46份中国芹菜品种及7份西芹品种的总DNA为材料，对EST—SSR在芹菜上的应用可行性进行验证，53份芹菜品种的12个微卫星位点共检测到32个等位基因，等位基因2(引物4)～4个(引物 11)，平均等位基因数为2．7个；并对53份材料的亲缘关系进行了鉴定。关键词：芹菜；EST；SSR；亲缘关系中图分类号：S636．3；Q78文献标识码：A EST—SSR of analysiscelery(Apiumgraveolens) CHU Ke—feih2， Yun—xial’27，HUANG Zhi-chen91’2，LIShou-gu02，GU CHEN Hai-ron91’弘．GUXiao—jun2 (1Institute Standardsand forAgri—Food TestingTechnology，ShanghaiAcademyofAgricultural PlantNew DUSTestCenterat 201403，China；2 Sciences，Shanghai Variety Shanghai，Ministryof 201415，China；3Schooland Agriculture，Shanghai ofAgricultureBiology，ShanghaiJiaotong 200240，China) University，Shanghai totheESTdata the irredundantEST Abstract：According publishedby NCBI，324 sequences 175．294kb were aseriesofsoftware 25 found long obtained treatments，andSSRswere from through 23 tooneSSR 7．011kbEST ofEST-SSR per sequence．Fifteen prim- sequences，beingequivalent