赣南柑橘产区衰退病毒外壳蛋白基因初步分析.pdfVIP

南方农业学报JournalofSouthern 2015，46(1)：15—20 Agriculture ISSN 2095—1 NNXAAB 191；CODEN http：／／www．nfnyxb．an DOI：10．3969／j：issn．2095-1191．2015．1．15 赣南柑橘产区衰退病毒外壳蛋白基因初步分析 刘志芳1．2，易 龙1，扩，卢占军1，2，高玉霞12 (1国家脐橙工程技术研究中心，江西赣州341000；2赣南师范学院生命与环境科学学院，江西赣州341000) 及序列遗传信息分析，为利用弱毒株交叉保护法预防该地区CTV的蔓延奠定基础。【方法】运用RT．PCR扩增样品的CP 基因并测序，应用软件检测cP序列基因重组，分析碱基含量，再将所测序列与10个外国CTV分离株计算核苷酸遗传距 离，比对序列同源性及构建系统发育树。【结果】214份柑橘样品中有78份感染了CTV，发病率为36．4％。78个样品中仅 有一个存在基因重组现象；78个CTV分离株cP基因全长序列均为672 bp，无碱基缺失、插入等现象，cP基因平均GC含 cⅣ分离株可聚为四大类群，第1类群包含49个分离样品和7个症状不同的已知CTV分离株(6个强毒型和1个弱毒 由采自瑞金的CRJl4组成；第Ⅳ类群包括一个国外强毒株系HAl6—5和采自江El、宁都的样品。【结论】赣南柑橘产区 CTV分离株的c尸基因保守性较高，序列存在一定程度的变异；各分离株间亲缘性较高但关系复杂，大部分样品与强毒 型和茎陷点型分离株相关。 关键词：柑橘衰退病毒；外壳蛋白基因；序列分析；基因重组 中图分类号：$436．66 文献标志码：A analoncoatcoatroteineneofCitrlltrustristezatristeza Preliminaryanalysis．)on proteinR,,ne fromcitrus inSouth productionregions Jiangxiprovince LIU 1…，YI 1，LU Yu-xial，2 Zhi—fangLong Zhan-junl…，GAP Navel Research ofLifeand (1National 341000，China；2School OrangeEngineeringTechnologyCenter，Ganzhou，Jiangxi Environmental Normal Sciences，Gannan 341000，China) University，Ganzhou，Jiangxi wasconductedtoclonecoat ofcitrustristezavirus(CTv) Abstract：【0biective】Thepresentstudy proteingene collectedfromGannannavel of its information．inorder