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天津医科大学博士学位论文国内分离的致肾盂肾炎大肠埃希菌
天津医科大学博士学位论文
国内分离的致肾盂肾炎大肠埃希菌 papA和papG基因分型的研究
博士研究生:吴庆刚导师:陈锦英
中文摘要
尿路感染是一种常见病、多发病,大肠埃希菌为其主要致病菌,导致 上行性尿路感染的大肠埃希菌大多具有P菌毛,称为致肾盂肾炎大肠埃希 菌(UPEC)。编码P菌毛的粘附基因群(pap)位于UPEC的染色体上,由 11个基因组成,其中papA编码P菌毛的主要菌毛结构亚单位,papG编 码P菌毛尖端与屎道上皮细胞表面受体Gal..Gal结合的真正粘附素。近年 来,UPEC papA和papG因在P菌毛组成和粘附致病中的重要作用而成为
研究的焦点,尤其对papA和papG的基因分型研究在UPEC的流行病学、
致病机理、遗传变异和免疫防治研究中的作用在国外越来越引起人们的关 注.国内尚处于空白。
首先,本研究建立了UPECpapC PCR的方法,在其扩增片段内设计了 PstI内切酶位点,可用于PCR产物的鉴定,提高该方法的特异性。采用 上述方法对国内分离的147株尿源性大肠埃希菌进行检测,UPEC菌株检 出率为31.98%(47/147株)。与血凝试验相比较,两种方法检测结果无明 显差异(PO.05)。继而采用多重PCR方法对45株UPEC菌株分别进行 了papA和paps的基因分型,探讨国内UPEC菌株的papA和papO的基
因组合形式。结果显示,45株UPEC papG的基因型均为Ⅱ型,与国外报 道显著不同。其中44株(97.8%)papA基因分型结果阳性,1株(2.2%) DapA结果阴性,预示为新的papA基因型。44株UPEC papa分型结果表
天津医科大学博士学位论文明,24株(54.55%)具有1个基因型,13株(29.55%)具有2个基因型,
天津医科大学博士学位论文
明,24株(54.55%)具有1个基因型,13株(29.55%)具有2个基因型, 4株(9.09%)和3株(6.82%)分别具有3个和4个基因型。单一基因 型较常见的为F7-2(25.00%)、F1l(6.82%)和F16(9.09%)。受试菌株 各种基因型出现的频次,优势基因型依次为:F10和F13各12株(27.27%)、 F7—2和F11各11株(25.00%)、F1410株(22.72%)和F16 9株(20.45
%);具有2个以上基因型的组合形式与国外不同,并首次发现了4个基 因型(FS+F9+F13+F14)组合的UPEC菌株。表明国内UPEC菌株存在 papA的多态性。
同时,采用PCR克隆的方法对papA多重PCR不能分型的UPEC 4030 株的papa和papG基因克隆和序列分析,结果显示,papA由720个核苷 酸组成,编码192个氨基酸的多肽。与国外报道的10个基因型的papA 核苷酸序列和推导氨基酸序列同源性比较,分别为36.11~77.95%和 21.11~78.34%;与papA基因分型多重PCR引物比较,UPEC4030在各 基因型下游引物相应位置序列同源性仅为10~66.67%,表明该菌株papa 确实为新基因型,并验证了papA基因分型方法的可靠性。UPEC4030与 天津地区曾报道UPECl32(F13型)papA核苷酸和推导氨基酸序列比较, 其同源性分别为49.70%和46.18%,变异部位主要出现在可变区和 Cys.Cys区:但papG均为Ⅱ型,其核昔酸和推导氨基酸序列同源性分别为 98.89%和99.01%。
综上所述,国内分离UPEC菌株papG高度保守;而papA呈现高度 多态性,并出现与I塞lJl,不同的基因型,有关l|缶床和流行病学意义值得深入 研究。
关键词:致肾盂肾炎大肠埃希菌粘附papa papG基因分型
天津医科大学博士学位论文Studies
天津医科大学博士学位论文
Studies on papA and papG Genotyping of Uropathogenic Escherichia coil Strains Isolated in China
Ph.D.Candidate:Wu qinggang Supervisor:Professor Chen Jinying Ti舭ji.Medical University(Tianjin 300070)
Abstract
Urinm7 tract infection 6yrI)is a c4Ⅲllmon and fi,equently occurring disease. Escherichia coli is its pmogco.Most E.∞li isolated from Iine of删酬临with upper
urinary tract
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