Bright Yellow 2烤烟热激蛋白90生物信息学分析.pdfVIP

南方农业学报 JournalofSouthernAgriculture 2017，48（10）：1734-1740 ·1734· ISSN2095-1191；CODENNNXAAB 南 方 农 业 学 报 48卷 DO ：10.3969/j.issn.2095-1191.2017.10.02 BrightYellow2烤烟热激蛋白90生物信息学分析 1 2 2 2 2 2 1* 陈二龙，苏家恩，范志勇，朱 凯，王德勋 ，孙军伟 ，宋朝鹏 1 2 （河南农业大学 烟草学院，郑州 450002 ；云南省烟草公司 大理州公司，云南 大理 671000） 摘要：【目的】分析Bright Yellow 2烤烟热激蛋白90（HSP90）的生物学信息，为揭示烘烤过程中烟叶的烘烤特性提 供理论依据。【方法】从NCBI 中获取Bright Yellow 2烤烟HSP90蛋白序列NtHSP- 1、NtHSP-2和NtHSP-3（GenBank登录 号分别为BAL42333 、BAL42332和BAM24708 ），利用生物信息学软件对各序列进行理化特性、跨膜区、信号肽、亚细 胞定位、二级结构和三级结构预测分析。【结果】Bright Yellow 2烤烟NtHSP- 1、NtHSP-2和NtHSP-3的氨基酸数量分别 为812、811和699个，均以酸性氨基酸含量较多，其中谷氨酸（Glu ）含量最高，理论等电点均小于5.00 ，二级结构均以α- 螺旋（H ）和无规则卷曲（C ）为主。NtHSP- 1和NtHSP-2 的亲水性较高，具有较高的稳定性，属于分泌蛋白，具有锚定结 构，定位于内质网，其三级结构呈现“r”形，N端内部具有Mg2+结合位点、HATPase_c （ATP酶）和top6b （DNA拓扑异构酶 VI ）功能域；NtHSP-3为非分泌型蛋白，定位于叶绿体，三级结构呈现“i”形，N端含有Mg2+结合位点和HATPase_c功能 域。【结论】NtHSP- 1和NtHSP-2可能与烟叶耐烤性有关，而NtHSP-3可能与烟叶易烤性有关。 关键词：烤烟；Bright Yellow 2 ；热激蛋白90（HSP90 ）；生物信息学；烘烤 中图分类号：S572.03 文献标志码：A 文章编号：2095-1191（2017 ）10-1734-07 Bioinformaticsanalysisforheatshockprotein90influecured tobaccovarietyBrightYellow2 1 2 2 2 2 CHEN Er-long ，SU Jia-en ，FAN Zhi-yong ，ZHU Kai ，WANG De-xun ， 2 1* SUN Jun-wei ，SONG Zhao-peng 1