南海球形棕囊藻质体16SrDNA序列分析-生态环境学报.PDF

生态环境学报 2011, 20(12): 1898-1901 Ecology and Environmental Sciences E-mail: editor@ 南海球形棕囊藻质体 16S rDNA 序列分析 马奔，章群，司从利，黄小彧 暨南大学水生生物研究所，广东 广州 510632 摘要：测定了采自香港2 株球形棕囊藻和湛江 1 株等鞭金藻质体 16S rDNA 基因序列，结合GenBank 中下载的32 条同源序 列，分析序列特征并构建分子系统树。发现600 bp 序列中有可变位点42 个，简约信息位点33 个，可变位点和简约信息位 点分别为全序列的7.0%和5.5%。A+T 的含量（52.5% ）略大于C+G 含量（47.5% ）,与已报道的棕囊藻属叶绿体和线粒体基 因相似；在分子系统树上，同属藻种聚类在一起，属间遗传距离分别为0.025 5~0.050 3。棕囊藻属属内遗传距离0-0.005 0 ， 不同藻种相混杂，并未独立成支；质体 16s rDNA 部分序列虽不能区分棕囊藻属内不同藻种，但能鉴定出GenBank 中27 个 环境样品为棕囊藻属藻株，从而能确定其地理分布和相对丰度，对棕囊藻赤潮的预测预报具有重要意义。质体 16s rDNA 在 其他赤潮藻类物种鉴定方面的应用需要进一步研究。 关键词：赤潮；棕囊藻；质体 16S rDNA 中图分类号：X173 文献标志码：A 文章编号：1674-5906 （2011 ）12-1898-04 棕囊藻属 (Phaeocystis) 隶属定鞭藻纲 体、脂肪酸、光和色素等细胞组分作为生理生化指 (Prymnesiophyceae)定鞭藻目(Prymnesiales)棕囊藻 标应用在藻类分类研究上，但结果都不太理想[6-9]。 科(Phaeocystaceae) ，主要分布南、北两极及寒、温 近些年，随着分子生物学的发展，DNA分子标 带，近些年越来越频繁地在中低纬度地区形成赤 记因操作相对简单易行，准确度高而成为区分物种 潮。棕囊藻能产生细胞溶血毒素、二甲基丙磺酸、 的有效手段。目前，关于棕囊藻的DNA分子标记研 二甲基硫化物等有害物质，直接或间接地影响人类 究主要集中在18S rDNA，28S rDNA ，rDNA ITS 区， 健康，释放到大气中的二甲基硫化物还能引发酸雨 PsaA ，PsbA基因等，但是这些序列在种以上的类群 [1] 。棕囊藻藻体周围包裹的胶质囊可阻塞海洋鱼类 区分中具有优势，在物种的区分中就不那么明显 的呼吸器官使其窒息而死；大量繁殖的藻体不仅会 [2,10]。16S rDNA既具有保守序列，也具有高度可变 造成水体缺氧，同时藻体腐烂后可使水体变质，严 序列，在各种细菌、真菌中具有较好的区分度，是 重影响生态景观，严重威胁海洋生物的生存，对水 用于微生物分类鉴定较为理想的分子标记。由于棕 产养殖等造成巨大危害[2-3] ，如2010 年 5 月～6 月 囊藻属质体起源于细菌质粒，为此本文测定了2株 发生在秦皇岛昌黎沿海海域的赤潮灾害造成直接 棕囊藻和1株等鞭金藻质体16S rDNA基因序列，并 经济损失约2 亿元[4]。实时监控并及时发现赤潮藻 与GenBank 中同源序列进行比较，探讨质体16S 类，将有助于预防和减少赤潮藻类对生态环境所带 rDNA基因序列用于棕囊藻属物种鉴定的可行性， 来的危害，因此开展有害赤潮藻类的分类鉴定工作 以期为棕囊藻属藻类的鉴定提供新的分子标记。 尤为重要。 1 材料与方法 目前，棕囊藻的分类仍以形态特征为主，由于 1.1 材料与方法 具有复杂的异型生活史，在不同的发育阶段具有不 球形棕囊藻P1 、P2和等鞭金藻（Isochrys