甘蔗ATP结合蛋白基因克隆及其干旱胁迫下的表达特性分析.pdfVIP

南方农业学报10urnalofSouthelTI Agrlculture2017，48(9)：1537—1547 ISSN 2095—1191；CODENNNXAAB http：／／www．nfnyxb．com 191．2017．09．01 DOI：10．3969，j．issn．2095-1 甘蔗ATP结合蛋白基因克隆及其 干旱胁迫下的表达特性分析 曹辉庆1，蒋胜理1，黄诚梅1，邓智年2，吴凯朝2，徐林2，罗海斌1，陆珍1，魏源文P (’广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室，南宁530007；2广西农业科学院甘蔗研究所／农业部广西甘蔗生物技术 与遗传改良重点实验室／广西甘蔗遗传改良重点实验室，南宁530007) 摘要：【目的】克隆甘蔗ATP结合蛋白基因，分析其基本生物学信息及在干旱胁迫下的表达特性，为ATP结合蛋白 的功能研究提供理论依据。【方法】从乙烯诱导甘蔗差异表达转录组和水分胁迫下甘蔗cDNA文库中获取ATP结合蛋 白基因序列，设计其引物进行RT-PCR扩增，利用生物信息学软件进行序列分析及其蛋白结构和功能预测，并采用实 时荧光定量PCR(qPCR)检测干旱胁迫处理下的甘蔗ATP结合蛋白基因的表达情况。【结果】克隆获得的甘蔗ATP结合 蛋白基因全长2145 kD，理论等电点(pI)为9．33，不稳定系数为 bp，编码714个氨基酸，其蛋白分子质量为79．430 44．38；甘蔗ATP结合蛋白与玉米ATP结合蛋白的核苷酸序列及其推导氨基酸系列同源性最高，均达93％。甘蔗ATP结 合位点、核苷酸结合位点(NBS)、糖基化位点、激酶磷酸化结合位点及核定位信号等；甘蔗ATP结合蛋白可能主要定 位在细胞核、叶绿体、线粒体和过氧化物酶体中，起中间代谢调控作用，或参与转录调控、免疫应答、胁迫应答及信号 d后，甘蔗ATP结合蛋白基因的表达量明显下调，约为对照的 转导等生物反应。qPCR检测结果显示，在干旱胁迫7 30％，恢复正常供水(复水)后，表达量回升。【结论】甘蔗ATP结合蛋白基因表达受干旱胁迫诱导，可能参与甘蔗对干 旱逆境胁迫响应的代谢调控。 关键词：甘蔗；AT瞄合蛋白；基因克隆；生物信息学；干旱胁迫；表达特性 中图分类号：$566．1 文献标志码：A ofATP in andits Cloningbindingproteingenesugarcane characteristicsunder stress expression drought CAO Zhi—nian2， Hui～qin91，JIANGSheng—lil，HUANGCheng—meil，DENG WU Yuan—we／11’ Kai-cha02，XULin2，LUO Zhenl，WEl Hai．bin91，LU Genetic and Research 530007，China；2Sugarcane (1GuangxiCrop ImprovementBiotec