生物活性大分子的理性设计跟高效制备version for print文档资料.pptVIP

生物活性大分子的理性设计和高效制备 汇报人: 王正祥 报告内容 研究背景 研究内容 主要研究成果 致谢 研究背景 一级结构与空间结构 一级结构与生物活性 基因(DNA 序列)?mRNA?蛋白质（氨基酸序列）?功能 我们感兴趣的分子 工业用酶、重组多肽药物 科学和技术问题 蛋白分子特性与一级结构间精确关系 创建新分子 酶分子合成与分泌与其宿主细胞自身生理、生化活动的和谐平衡 高效、低成本、大规模制备和工业应用 主要研究内容 原始来源: 生物资源和信息 分子特性: 分子信息及其分析技术 实验创建: 新型生物活性分子组建技术 高效制备: 新型外源基因表达系统 研 究 结 果 搭建了工业微生物资源和信息共享数据库和相应的网站 生物信息学分析方法、数据库的建立与应用 数据集: 脯氨酸肽键，二硫键空间结构以及α-淀粉酶、木聚糖酶和耐热酶的序列、结构数据集。 方法学: 基于神经网络、支持向量机和隐马尔可夫模型预测脯氨酸肽链构象；基于氨基酸和二肽含量的二元线性分类器预测蛋白质半胱氨酸氧化还原状态。 应用: 肽链中脯氨酸特征, 二硫键结构特征, α-淀粉酶性能与结构关系, 木聚糖酶性能与序列、结构的关系以及分子进化, 嗜热菌耐热性与蛋白质序列、结构和功能关系。 Cooperativity of the oxidization of cysteines in proteins. Bioinformatics. In press. The influence of dipeptide composition on protein thermostability. FEBS Lett 2004, 569: 284~288. A novel method of analyzing proline synonymous codons in Escherichia coli. FEBS Lett 2004, 576(3): 336~338. Computational analysis of responsible dipeptides for optimum pH in G/11 xylanase. Biochem Biophys Res Commun 2004, 321(2): 391~396. Principle component analysis in F/10 and G/11 xylanas. Biochem Biophys Res Commun 2004, 322(1): 277~280. Prediction of the disulfide bonding state of cysteines in proteins based on dipeptide composition. Biochem Biophys Res Commun, 2004, 318, 1: 142~147. Related dipeptide and characteristic dipeptide of optimal pH in α-amylase. Biochem Biophys Res Commun 2002, 299(4): 647~651. Support vector machines for prediction of peptidyl prolyl cis/trans isomerization. J Pept Res 2004, 63: 23~28. Cooperativity of the oxidization of cysteines in globular proteins. J Theor Biol 2004, 231(1): 85~95. A novel model to calculate dipeptides responsible for optimum temperature in F/10 xylanase. Process Biochem 2005, 40: 1389~1394. 实践了新型生物活性分子组建方略 建立了工业生物技术共性共享平台 代表性成果1:  高温酸性a-淀粉酶 淀粉生物加工和生物转化获得的重要工业产品 新型高温酸性a-淀粉酶研制过程 新型高温酸性a-淀粉酶的主要酶学性质 新型α-淀粉酶的酶学性质优于现有产品 Novo公司的高温a-淀粉酶：最适pH 5.6-6.5, 有效pH 5.3-6.8, 最适温度 95 ℃, 耐热性(T1/2) 100 ℃，20min。 重组酶的高效制备 重组菌产酶水平显著高于国内现有水平 国内企业生产的高温α-淀粉酶：最适pH6.0-7.0, 有效pH 5.5-7.5 , 最适温度 95 ℃, 耐热性(T1/2) 100℃,