全基因组关联研究现状.doc

全基因组关联研究现状 通HEREDITAS(Beijing)2011年1EJ,33(1):25--35 ISSN0253—9772WWW.综述 DoI:10.3724/SP.J.1005.2011.00025 全基因组关联研究现状 韩建文,张学军 安徽医科大学皮肤病学研究所,合肥230032 摘要:在过去的5年中,全基因组关联研究(Genome—wideassociationstudy,GWAS)方法已被证明是研究复杂疾 病和性状遗传易感变异的一种有效手段.目前,各国科学家在多种复杂疾病和性状中开展了大量的GWAS,对 肿瘤,糖尿病,心脏病,神经精神疾病,自身免疫及免疫相关疾病等复杂疾病以及一些常见性状(如身高,体 重,血脂,色素等)的遗传易感基因研究取得了重大成果.截止到2010年9月11日,运用GWAS开展了对近 200种复杂疾病/性状的研究,发现了3000多个疾病相关的遗传变异.文章就GWAS的发展及其在复杂疾病/ 性状中的应用做一综述. 关键词:全基因组关联研究;复杂疾病;性状;易感基因 Currentstatusofgenome—wideassociationstudy HANJian-Wen,ZHANGXue—Jun InstituteofDermatologyofAnhuiMedicalUniversity,Hefei230032,China Abstract:Inpastfiveyears,genome—wideassociationstudy(GWAS)hasproventobeapowerfulandefficientstudy designinidentifyinggeneticvariantsassociatedwithcomplexdiseasesandtraits.Manystudieshavebeenperformedto explorethegeneticbasisofvariouscomplexdiseasesandtraits.Geneticbreakthroughshavebeenachievedincomplex diseasesandtraits,suchasoncology,diabetes,cardiology,psychiatricdisorders,autoimmuneandimmunerelateddiseases, height,weight,bloodlipid,andpigmentation.UptoSeptember112010,nearly200complexdiseasesandtraitshavebeen investigatedbythisapproach,andmorethan3000diseasesand/ortraitsrelatedvariantshavebeenidentified.Inthisreview, wepresentanoverviewofGWASincomplexdiseasesandtraits. Keywords:genome—wideassociation;complexdiseases;traits;susceptibilitygene 复杂疾病/性状是由多个微效基因与环境因素 共同作用所致,具有明显的遗传异质性,表型复杂 性及种族差异性等特征.常见的复杂疾病/性状包括 肿瘤,糖尿病,心脏病,神经精神疾病,自身免疫 及免疫相关疾病,眼科疾病,感染性疾病,消化系 统疾病等严重影响人类身心健康的常见疾病,以及 身高,体重,血脂,色素等性状.遗传因素在复杂 疾病/性状的发生中起到重要作用.2005年以来,随 着人类基因组计~1](Humangenomeproject.HGP) 和人类基因组单体型图计J~JJ(Theinternationalhap. 1otypemapproject,HapMap)的相继完成,以及高通 量基因分型技术的飞速发展,全基因组关联研究 (Genome—wideassociationstudy,GWAS)方法被广泛 应用到多种复杂疾病/性状的遗传学研究中,并取得 了一系列研究成果.本文就全基因组关联研究的发 展及其在复杂疾病/性状中的应用做一综述. 收稿日期:2010-08—16:修回日期:2010—10-29 基金项目:国家863计划项目(编号:2O07AAO2z161)资助 作者简介:韩建文(198l一),男,博士,专业方向:复杂疾病遗传学.E-mail:hanjianwen1981@ 通讯作者:张学军(1955一),男,博士,主任医师,教授,博士生导师,研究方向:复杂疾病遗传学.E-mail:ayzxj@ 篷HEREDITAS(Beijing)2011第33卷 1GWAS的形成 1.1GWAS的研究背景