生物信息学 复习重点教材编辑.pptVIP

生物信息学 复习重点;生物信息学从事对基因组研究相关生物信息的获取、加工、储存、分配、分析和解释。;生物信息学数据库;生物信息学数据库;序列数据库;Entrze检索系统：NCBI SRS检索系统：EMBL、DDBJ;数据格式;The Swiss-Prot groups from the SIB and the EBI (2002) - (Photo by : Amos Bairoch, SIB);;结构数据库;2.MMDB;NCBI;NCBI; “对于总是把他们亲爱的人的健康摆在首位的美国公民来说,他们可以为他们的国立医学图书馆而骄傲。 因为她从研究中获取生命科学的知识,加以组织并传播给最可能利用这些知识的人,以便他们同疾病、伤残作斗争,提高我们大家生命的素质” 。;MEDLINE;MeSH是Medical?Subject?Headings的缩略词，即医学主题词，是用规范化的医学术语来描述生物医学概念。NIH的工作人员按MeSH词表规定，浏览生物医学期刊全文后标引出每篇文献中的MeSH主题词，其中论述文献中心的主题词称主要主题词（major topic?headings），论述主题某一方面的内容的词称为副主题词。 ;（二）短语检索 如果在短语上加双引号，将不执行转换功能 例如： “single cell” ;（三）布尔逻辑运算： AND、OR、NOT必须大写 比如“single cell” AND “Vitamin C”;（四）截词检索：* 例：输入bacter*，检出bacteria、bacterium等 备注：将不执行转换功能； 截词检索只限于单词，对词组无效， ;NCBI;最主要的以下三种;《生物信息学》第五、六讲;建立评分矩阵;Dr. Margaret Oakley Dayhoff, credited as the founder of Bio-Informatics, ca. 1980 ;;Relationship between scoring matrices. The BLOSUM62 has become a de facto standard scoring matrix for a wide range of alignment programs. It is the default matrix in BLAST ;;0.3=2-（1+2/3）;《生物信息学》第七、八讲;BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) is a set of similarity search programs that explore all of the available sequence databases for protein or DNA. ;;E-value;;;HHAFDEG ACDEGGG;《生物信息学》第九、十讲;A;A;;　2001年2月，文特尔小组所做的人类基因组测序报告发表在《科学》杂志上 ;“复杂而没有生命的化学物质可以构成我们的遗传密码，这是如此的奇妙，更能体现人类的精神，足以让哲学家和诗人们感叹一千年”;去生活，???犯错，去跌倒，去胜利，去用生命再创生命。 ----詹姆斯·乔伊斯 ;名词翻译;名词解释 ;;简答题;;;Good Luck