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生物信息学
Bioinformatics;第四章 DNA与蛋白质序列分析;复习- 第1节 序列比对
;复习
;Blast简介;Blast程序评价序列相似性的两个数据;主要的blast程序;/Blast.cgi;BLAST检索中采用的数据库类别：
蛋白数据库：
nr: 无冗余数据库，汇集了GenBank中所有的蛋白序列+PDB+Swissprot+PIR等汇集；
;BLAST检索中采用的数据库类别：
核酸数据库：
nr/nt: 无冗余数据库，汇集了GenBank+DDBJ+EMBL中所有的核甘酸序列（不包括EST)
;BLAST的应用;具体步骤;;;;;;
提高期望阈值（Expect threshold）;
降低延伸种子序列的长度(word size)
主要用途：搜索短的基序，如验证PCR引物的特异性;Blastn---1;Blastn---1;Blastn---1;Blastn---1;Blastn---1;Blastn---1;Blastn---2;Blastn---2;Blastn---2;Blastp;Blastp;Blastp;Blastp;Blastp;Blastp;Blastp;Blastx;Blastx;Blastx;Blastx;Blastx;tBlastn;tBlastn;tBlastn;Blastx;Question:
1. 我刚刚分离一个水稻基因片??序列，大概250bp，我想初步分析一下它是什么基因，编码什么产物以及是否已经被别人克隆，应该采用什么工具和数据库？
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