长鳍鲤mtDNADrloop区序列结构和多态性分析.PDFVIP

江苏农业科学　２０１３年第４１卷第８期 — ２７— 邹芝英，杨　弘，罗永巨，等．长鳍鲤ｍｔＤＮＡＤ－ｌｏｏｐ区序列结构和多态性分析［Ｊ］．江苏农业科学，２０１３，４１（８）：２７－３０． 长鳍鲤 ｍｔＤＮＡＤ－ｌｏｏｐ区序列结构和多态性分析 １ １ ２ １ １ １ １ 邹芝英 ，杨　弘 ，罗永巨 ，吴长敬 ，李大宇 ，祝瞡琳 ，肖　炜 （１．中国水产科学研究院淡水渔业研究中心／农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室，江苏无锡２１４０８１； ２．广西水产研究所，广西南宁５３００２１） 　　摘要：采用ＰＣＲ技术和测序的方法分离长鳍鲤线粒体ＤＮＡ控制区（ｍｔＤＮＡＤ－ｌｏｏｐ）的部分序列（６００～６０２ｂｐ）， 结合已报道长鳍鲤序列（３８７ｂｐ），得到长鳍鲤Ｄ－ｌｏｏｐ区的全长序列（９２１ｂｐ），对照其他已报道的鱼类控制区结构， 成功识别长鳍鲤ｍｔＤＮＡＤ－ｌｏｏｐ区的终止序列区、中央保守区和保守序列区，找到了终止相关的序列ＴＡＳ和ＣＳＢ－Ｆ、 ＣＳＢ－Ｅ、ＣＳＢ－Ｄ、ＣＳＢ－１、ＣＳＢ－２、ＣＳＢ－３等６个特征序列，运用ＤＮＡ分析软件对本研究获得的序列（６００～６０２ｂｐ） 进行序列多态性分析。结果显示，序列碱基Ａ＋Ｔ的含量（平均为６２．７％）高于Ｇ＋Ｃ的含量（平均为３７．３％），共检 测到１３个变异位点，转换为８个，颠换为３个，有２个缺失，碱基的替换有明显的偏倚。８尾个体分属６种单倍型，长 鳍鲤的核苷酸多样性为０．００７３２，单倍型间平均遗传距离为０．００９。稀有长鳍鲤种群ｍｔＤＮＡＤ－ｌｏｏｐ区序列存在着丰 富的多态性，说明该种群具有比较丰富的遗传多样性。 　　关键词：长鳍鲤；ｍｔＤＮＡ；Ｄ－ｌｏｏｐ区；遗传多样性 　　中图分类号：Ｑ３４８；Ｓ９１７．４　　文献标志码：Ａ　　文章编号：１００２－１３０２（２０１３）０８－００２７－０４ 　　长鳍鲤（Ｃｙｐｒｉｎｕｓｃａｒｐｉｏｖａｒ．ｌｏｎｇｆｉｎ）属于鲤科鲤属鲤种， 捕捞等因素的影响，现野生分布的长鳍鲤已基本消失，品种资 是分布于我国广西壮族自治区的一种野生鲤鱼，因其身体各 源已经变得非常宝贵。为保护物种资源，广西自治区水产研 鳍条的长度均比普通鲤鱼长而得名。由于受环境变化和人为 究所将野生长鳍鲤引入池塘。目前，关于长鳍鲤的研究特别 ［１－２］ 是遗传结构和遗传多样性的研究报道很少 。动物线粒体 收稿日期：２０１３－０１－１４ ＤＮＡ（ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌＤＮＡ，ｍｔＤＮＡ）是共价闭合的环状双螺旋 基金项目：国家现代农业产业技术体系建设专项（编号：ＣＡＲＳ－４９）； ＤＮＡ，是细胞核外具自主复制、转录和翻译能力的遗传因子， 中央级公 益性科 研 院所 基 本 科 研 业 务 费专项 （编号： 具有分子量小、结构简单、进化速度快、高度多态、母性遗传等 ２０１１ＪＢＦＡ０４）。 特点。ｍｔＤＮＡＤ－ｌｏｏｐ区别称控制区，是线粒体基因组序列 作者简介：邹芝英（１９８０—），女，江苏无锡人，硕士，助理研究员，主要 和长度变异最大、进化最快的区域。它因具有较高的突变积 从事产养殖与分子生物学研究