酵母核小体中心序列局域偏好和连接序列的多样性.pdfVIP

第 卷 第 期 陕西师范大学学报（自然科学版） ４５ ３ Ｖｏｌ．４５ Ｎｏ．３ 　 　 年 月 （ ） ， ２０１７ ５ ＪｏｕｒｎａｌｏｆＳｈａａｎｘｉＮｏｒｍａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔ ＮａｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅＥｄｉｔｉｏｎ Ｍａ ２０１７ 　 　 ｙ ｙ 文章编号： （ ） ： ／ １６７２４２９１２０１７０３００７３０７ 犱狅犻１０．１５９８３ ．ｃｎｋｉ．ｓｎｕ．２０１７．０３．３３５ ｊ ｊ 酵母核小体中心序列局域偏好和连接序列的多样性  郑 燕，李 宏 ，贾 芸，孟 虎 　 　 　 　 （内蒙古大学 物理科学与技术学院，内蒙古 呼和浩特 ０２００２１） 摘 要：基于酵母单碱基精度的核小体位置数据，提取核小体中心及连接序列分析两类序列的精细 　 结构和模体偏好。结果显示，区分两类序列最主要的是稀有模体（ 、 、 和 ），其次 ＧＣＧ ＣＧＣＣＧＧ ＣＣＧ 是富含模体（ 和 ）。将核小体中心序列等分为 个单元，发现中单元与核小体中心序列 ＡＡＡ ＴＴＴ ３ 相对偏差的分布相似，两翼单元分布部分类似于连接序列，表明中单元的核小体定位信号强而两翼 具有连接序列的部分序列特征。通过分析 个核小体连接序列长度组的 含量发现其长度 １１ Ｇ＋Ｃ 与 含量成负相关，而 模体搜索结果显示 个长度组主要有 类保守模体，意味着连 Ｇ＋Ｃ ＭＥＭＥ １１ ４ 接序列的多样性。 关键词：酵母；核小体；３ｍｅｒ；相对偏差；保守模体 中图分类号：Ｑ６１ 文献标志码：Ａ 　　 犜犺犲犾狅犮犪犾狉犲犳犲狉犲狀犮犲狅犳狀狌犮犾犲狅狊狅犿犲犮狅狉犲狊犲狌犲狀犮犲狊犪狀犱 狆 狇 狋犺犲犱犻狏犲狉狊犻狋狅犳犾犻狀犽犲狉狊犲狌犲狀犮犲狊犻狀 犲犪狊狋 狔 狇 狔  ， ， ， ＺＨＥＮＧＹａｎ ＬＩＨｏｎ ＪＩＡＹｕｎ ＭＥＮＧＨｕ