脓毒症的基因组学与系统生物学研究概述.pptVIP

结束语 * * THANKS! * * This conceptual framework shows the interrelationships between infection, non-infectious disorders, SIRS, sepsis and severe sepsis. Components of the process not discussed on the following slides include: Infection: a microbial phenomenon characterized by an inflammatory response to the presence of microorganisms or the invasion of normally sterile host tissue by those organisms Bacteremia: the presence of viable bacteria in the bloodstream Septic shock: sepsis-induced hypotension despite adequate fluid resuscitation along with the presence of perfusion abnormalities that may include, but are not limited to, lactic acidosis, oliguria or an acute alteration in mental status Multiple organ dysfunction syndrome (MODS): presence of altered organ function in an acutely ill patient such that homeostasis cannot be maintained without intervention Bone RC, Balk RA, Cerra FB, et al. Definitions for sepsis and organ failure and guidelines for the use of innovative therapies in sepsis. Chest 1992;101:1644-55. Opal SM, Thijs L, Cavaillon JM, et al. Relationships between coagulation and inflammatory processes. Crit Care Med 2000;28:S81-2. * 随着基因组测序技术的进步，许多病原体的基因组测序得以完成，并建立了一系列的数据库，以此为基础人们能通过比较基因组学和功能基因组学手段研究病原微生物的功能进化。利用蛋白质组学技术、代谢组学技术和功能基因组学技术研究病原微生物的致病机制，开展病毒和细菌逃避免疫和致病的分子机制研究、宿主重要胞器和信号通路在病原体防御和致病中的功能研究、重要毒力因子在病原体致病中的功能研究、病毒易感性与人遗传多态性关系的研究等。 * 如美国建立的国家微生物病原体数据资源的网站，提供了大约50种病原菌的全基因组序列，可供研究者在此查询病原菌的基因组序列；并且通过整合全基因组信息与前人研究构建的功能基因子系统，从而提供了更完善的基因组功能注释；其自带的生物信息学工具和标签基因信息能很好地帮助研究者进行病原菌基因组的研究。 * 利用蛋白质组学技术、代谢组学技术和功能基因组学技术研究病原微生物的致病机制，开展病毒和细菌逃避免疫和致病的分子机制研究、宿主重要胞器和信号通路在病原体防御和致病中的功能研究、重要毒力因子在病原体致病中的功能研究、病毒易感性与人遗传多态性关系的研究等。如通过比较病原菌的毒力因子在宿主不同部位的表达差异，可以推导病原菌的致病机制，解释为何同一病原菌对机体器官损伤的不同。 * SNP的研究不少，如：…等等 * 呈时间差异性 * * 相互作用组是指在细胞、组织、器官或全部的有机体的完全的微分子相互作用，包括蛋白质-蛋白质，DNA-蛋白质，RNA-蛋白质等；随着人类基因组计划的开展，各种DNA、蛋白质等数据库的建立，尤其是蛋白质技术和微阵列技术的进步，使得从“组”的水平研究各种成分之间的相互作用得以实现，一些模式生物的相互作用网络图谱相继被绘制。如……2006年Tegner和他的同事利用LPS刺激人巨噬细胞，收集其转录组、转录因子的表达、启动子结构三部分信息并对三部分信息进行整合，绘制了巨噬细胞受LPS刺激后活化机制的相互作用网络图，找出关键的4个转录因