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麦胚凝集素亲和色谱富集糖肽过程中的肽键裂解
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卢- 庄 ,- 王京兰 ,- 贾- 伟 ,- 杨- 兵 ,- 蔡- 耘 ,
$ $ $ ,! !
- 邓玉林 ,- 张玉奎 ,- 钱小红
($* 北京理工大学,北京 $( $ ;! * 蛋白质组学国家重点实验室,
北京蛋白质组研究中心,北京放射医学研究所,北京 $!!+ )
摘要:蛋白质的糖基化是最重要的翻译后修饰之一,与蛋白质结构和功能的关系密切。凝集素亲和色谱是蛋白质
糖基化研究中很常用的工具,不同的凝集素可以对不同的单糖或寡糖有特异的富集作用。麦胚凝集素(9:; )由
于其特异作用的糖型广泛存在而成为使用最多的凝集素之一。在本研究中,发现将 9:; 用于糖肽亲和富集会导
致部分肽段的降解,从而导致后续的肽段序列分析的失败。本文用, 种标准蛋白质对这种现象进行了验证,结果
表明肽段的降解可以发生在多个位点,其中较多地发生在酪氨酸、苯丙氨酸及亮氨酸的羧基端。这一结果提示:在
糖蛋白质组研究中,如果应用 9:; 富集糖肽并采用质谱进行鉴定,则采用半酶切或非特异性酶切的检索策略更为
合适。
关键词:麦胚凝集素亲和色谱;糖肽;肽键;断裂;蛋白质组学
中图分类号:
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